Protein–RNA interactions for Protein: Q99795

GPA33, Cell surface A33 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPA33Q99795 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GPA33Q99795 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPA33Q99795 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPA33Q99795 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GPA33Q99795 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPA33Q99795 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPA33Q99795 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPA33Q99795 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPA33Q99795 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPA33Q99795 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPA33Q99795 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPA33Q99795 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPA33Q99795 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPA33Q99795 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPA33Q99795 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GPA33Q99795 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GPA33Q99795 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPA33Q99795 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPA33Q99795 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPA33Q99795 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPA33Q99795 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPA33Q99795 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPA33Q99795 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPA33Q99795 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPA33Q99795 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPA33Q99795 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPA33Q99795 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPA33Q99795 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPA33Q99795 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPA33Q99795 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPA33Q99795 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPA33Q99795 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPA33Q99795 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPA33Q99795 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPA33Q99795 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPA33Q99795 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPA33Q99795 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GPA33Q99795 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPA33Q99795 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPA33Q99795 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPA33Q99795 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPA33Q99795 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPA33Q99795 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPA33Q99795 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPA33Q99795 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPA33Q99795 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPA33Q99795 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPA33Q99795 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPA33Q99795 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPA33Q99795 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPA33Q99795 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPA33Q99795 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPA33Q99795 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPA33Q99795 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPA33Q99795 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPA33Q99795 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPA33Q99795 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPA33Q99795 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPA33Q99795 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPA33Q99795 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPA33Q99795 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPA33Q99795 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPA33Q99795 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GPA33Q99795 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPA33Q99795 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPA33Q99795 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPA33Q99795 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPA33Q99795 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPA33Q99795 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPA33Q99795 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPA33Q99795 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPA33Q99795 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPA33Q99795 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPA33Q99795 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPA33Q99795 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPA33Q99795 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPA33Q99795 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPA33Q99795 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPA33Q99795 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPA33Q99795 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPA33Q99795 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPA33Q99795 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPA33Q99795 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPA33Q99795 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPA33Q99795 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPA33Q99795 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPA33Q99795 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
GPA33Q99795 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
GPA33Q99795 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPA33Q99795 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPA33Q99795 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPA33Q99795 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPA33Q99795 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPA33Q99795 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPA33Q99795 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPA33Q99795 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPA33Q99795 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPA33Q99795 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPA33Q99795 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPA33Q99795 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.1 ms