Protein–RNA interactions for Protein: Q96NW7

LRRC7, Leucine-rich repeat-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC7Q96NW7 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LRRC7Q96NW7 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LRRC7Q96NW7 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LRRC7Q96NW7 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LRRC7Q96NW7 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LRRC7Q96NW7 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
LRRC7Q96NW7 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LRRC7Q96NW7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LRRC7Q96NW7 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LRRC7Q96NW7 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LRRC7Q96NW7 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LRRC7Q96NW7 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LRRC7Q96NW7 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LRRC7Q96NW7 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
LRRC7Q96NW7 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
LRRC7Q96NW7 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
LRRC7Q96NW7 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
LRRC7Q96NW7 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
LRRC7Q96NW7 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
LRRC7Q96NW7 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
LRRC7Q96NW7 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
LRRC7Q96NW7 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
LRRC7Q96NW7 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
LRRC7Q96NW7 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
LRRC7Q96NW7 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
LRRC7Q96NW7 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
LRRC7Q96NW7 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
LRRC7Q96NW7 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
LRRC7Q96NW7 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LRRC7Q96NW7 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LRRC7Q96NW7 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRRC7Q96NW7 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRRC7Q96NW7 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
LRRC7Q96NW7 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRRC7Q96NW7 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRRC7Q96NW7 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRRC7Q96NW7 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRRC7Q96NW7 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRRC7Q96NW7 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRRC7Q96NW7 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRRC7Q96NW7 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRRC7Q96NW7 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRRC7Q96NW7 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRRC7Q96NW7 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRRC7Q96NW7 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRRC7Q96NW7 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
LRRC7Q96NW7 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRRC7Q96NW7 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRRC7Q96NW7 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRRC7Q96NW7 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRRC7Q96NW7 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRRC7Q96NW7 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRRC7Q96NW7 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRRC7Q96NW7 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRRC7Q96NW7 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRRC7Q96NW7 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRRC7Q96NW7 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRRC7Q96NW7 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRRC7Q96NW7 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRRC7Q96NW7 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRRC7Q96NW7 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRRC7Q96NW7 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRRC7Q96NW7 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRRC7Q96NW7 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRRC7Q96NW7 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRRC7Q96NW7 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRRC7Q96NW7 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRRC7Q96NW7 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRRC7Q96NW7 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRRC7Q96NW7 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRRC7Q96NW7 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRRC7Q96NW7 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRRC7Q96NW7 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRRC7Q96NW7 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRRC7Q96NW7 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRRC7Q96NW7 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRRC7Q96NW7 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRRC7Q96NW7 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRRC7Q96NW7 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRRC7Q96NW7 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LRRC7Q96NW7 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LRRC7Q96NW7 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LRRC7Q96NW7 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LRRC7Q96NW7 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LRRC7Q96NW7 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LRRC7Q96NW7 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LRRC7Q96NW7 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LRRC7Q96NW7 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
LRRC7Q96NW7 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LRRC7Q96NW7 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LRRC7Q96NW7 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LRRC7Q96NW7 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LRRC7Q96NW7 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LRRC7Q96NW7 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LRRC7Q96NW7 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LRRC7Q96NW7 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LRRC7Q96NW7 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LRRC7Q96NW7 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LRRC7Q96NW7 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LRRC7Q96NW7 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms