Protein–RNA interactions for Protein: Q96M60

FAM227B, Protein FAM227B, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM227BQ96M60 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM227BQ96M60 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM227BQ96M60 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM227BQ96M60 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM227BQ96M60 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM227BQ96M60 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM227BQ96M60 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM227BQ96M60 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM227BQ96M60 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM227BQ96M60 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM227BQ96M60 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
FAM227BQ96M60 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM227BQ96M60 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM227BQ96M60 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM227BQ96M60 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM227BQ96M60 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM227BQ96M60 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM227BQ96M60 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM227BQ96M60 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM227BQ96M60 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM227BQ96M60 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM227BQ96M60 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM227BQ96M60 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM227BQ96M60 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM227BQ96M60 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM227BQ96M60 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM227BQ96M60 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM227BQ96M60 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM227BQ96M60 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM227BQ96M60 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM227BQ96M60 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM227BQ96M60 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM227BQ96M60 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM227BQ96M60 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM227BQ96M60 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM227BQ96M60 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM227BQ96M60 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM227BQ96M60 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM227BQ96M60 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM227BQ96M60 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM227BQ96M60 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM227BQ96M60 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM227BQ96M60 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM227BQ96M60 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM227BQ96M60 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM227BQ96M60 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM227BQ96M60 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM227BQ96M60 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM227BQ96M60 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM227BQ96M60 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM227BQ96M60 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM227BQ96M60 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM227BQ96M60 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM227BQ96M60 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM227BQ96M60 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM227BQ96M60 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM227BQ96M60 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM227BQ96M60 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM227BQ96M60 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM227BQ96M60 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM227BQ96M60 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM227BQ96M60 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM227BQ96M60 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM227BQ96M60 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM227BQ96M60 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM227BQ96M60 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM227BQ96M60 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM227BQ96M60 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM227BQ96M60 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM227BQ96M60 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM227BQ96M60 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM227BQ96M60 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM227BQ96M60 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM227BQ96M60 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM227BQ96M60 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM227BQ96M60 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM227BQ96M60 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM227BQ96M60 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM227BQ96M60 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM227BQ96M60 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM227BQ96M60 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM227BQ96M60 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM227BQ96M60 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM227BQ96M60 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM227BQ96M60 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM227BQ96M60 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM227BQ96M60 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM227BQ96M60 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM227BQ96M60 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM227BQ96M60 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM227BQ96M60 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM227BQ96M60 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM227BQ96M60 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM227BQ96M60 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM227BQ96M60 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM227BQ96M60 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM227BQ96M60 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM227BQ96M60 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM227BQ96M60 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM227BQ96M60 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms