Protein–RNA interactions for Protein: Q96JG6

VPS50, Syndetin, humanhuman

Predictions only

Length 964 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS50Q96JG6 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VPS50Q96JG6 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VPS50Q96JG6 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VPS50Q96JG6 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VPS50Q96JG6 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VPS50Q96JG6 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VPS50Q96JG6 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VPS50Q96JG6 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VPS50Q96JG6 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VPS50Q96JG6 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VPS50Q96JG6 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VPS50Q96JG6 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VPS50Q96JG6 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VPS50Q96JG6 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VPS50Q96JG6 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
VPS50Q96JG6 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
VPS50Q96JG6 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VPS50Q96JG6 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VPS50Q96JG6 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VPS50Q96JG6 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VPS50Q96JG6 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VPS50Q96JG6 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VPS50Q96JG6 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VPS50Q96JG6 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VPS50Q96JG6 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms