Protein–RNA interactions for Protein: Q96J65

ABCC12, Multidrug resistance-associated protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC12Q96J65 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ABCC12Q96J65 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ABCC12Q96J65 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ABCC12Q96J65 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ABCC12Q96J65 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ABCC12Q96J65 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ABCC12Q96J65 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ABCC12Q96J65 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ABCC12Q96J65 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ABCC12Q96J65 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ABCC12Q96J65 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ABCC12Q96J65 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ABCC12Q96J65 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ABCC12Q96J65 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ABCC12Q96J65 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ABCC12Q96J65 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCC12Q96J65 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCC12Q96J65 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCC12Q96J65 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCC12Q96J65 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCC12Q96J65 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCC12Q96J65 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCC12Q96J65 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCC12Q96J65 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCC12Q96J65 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCC12Q96J65 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCC12Q96J65 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCC12Q96J65 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCC12Q96J65 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCC12Q96J65 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCC12Q96J65 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCC12Q96J65 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCC12Q96J65 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ABCC12Q96J65 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ABCC12Q96J65 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ABCC12Q96J65 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ABCC12Q96J65 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ABCC12Q96J65 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ABCC12Q96J65 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ABCC12Q96J65 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ABCC12Q96J65 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ABCC12Q96J65 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ABCC12Q96J65 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ABCC12Q96J65 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ABCC12Q96J65 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ABCC12Q96J65 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ABCC12Q96J65 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ABCC12Q96J65 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ABCC12Q96J65 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ABCC12Q96J65 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ABCC12Q96J65 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ABCC12Q96J65 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ABCC12Q96J65 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ABCC12Q96J65 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ABCC12Q96J65 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ABCC12Q96J65 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ABCC12Q96J65 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ABCC12Q96J65 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCC12Q96J65 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCC12Q96J65 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCC12Q96J65 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCC12Q96J65 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCC12Q96J65 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCC12Q96J65 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCC12Q96J65 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCC12Q96J65 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCC12Q96J65 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCC12Q96J65 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCC12Q96J65 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCC12Q96J65 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCC12Q96J65 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCC12Q96J65 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCC12Q96J65 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCC12Q96J65 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCC12Q96J65 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCC12Q96J65 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCC12Q96J65 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCC12Q96J65 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCC12Q96J65 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCC12Q96J65 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCC12Q96J65 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ABCC12Q96J65 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ABCC12Q96J65 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ABCC12Q96J65 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ABCC12Q96J65 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ABCC12Q96J65 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ABCC12Q96J65 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ABCC12Q96J65 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ABCC12Q96J65 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ABCC12Q96J65 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ABCC12Q96J65 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ABCC12Q96J65 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ABCC12Q96J65 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ABCC12Q96J65 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ABCC12Q96J65 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ABCC12Q96J65 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ABCC12Q96J65 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ABCC12Q96J65 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ABCC12Q96J65 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ABCC12Q96J65 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms