Protein–RNA interactions for Protein: Q96CX3

ZNF501, Zinc finger protein 501, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF501Q96CX3 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF501Q96CX3 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF501Q96CX3 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF501Q96CX3 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF501Q96CX3 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF501Q96CX3 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF501Q96CX3 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF501Q96CX3 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF501Q96CX3 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF501Q96CX3 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF501Q96CX3 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF501Q96CX3 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF501Q96CX3 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF501Q96CX3 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF501Q96CX3 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ZNF501Q96CX3 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ZNF501Q96CX3 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ZNF501Q96CX3 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ZNF501Q96CX3 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ZNF501Q96CX3 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ZNF501Q96CX3 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ZNF501Q96CX3 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF501Q96CX3 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF501Q96CX3 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF501Q96CX3 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF501Q96CX3 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF501Q96CX3 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF501Q96CX3 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF501Q96CX3 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF501Q96CX3 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF501Q96CX3 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF501Q96CX3 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF501Q96CX3 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF501Q96CX3 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF501Q96CX3 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF501Q96CX3 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF501Q96CX3 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF501Q96CX3 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF501Q96CX3 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF501Q96CX3 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF501Q96CX3 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF501Q96CX3 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF501Q96CX3 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF501Q96CX3 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF501Q96CX3 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF501Q96CX3 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF501Q96CX3 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF501Q96CX3 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF501Q96CX3 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF501Q96CX3 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF501Q96CX3 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF501Q96CX3 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF501Q96CX3 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF501Q96CX3 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF501Q96CX3 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF501Q96CX3 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF501Q96CX3 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF501Q96CX3 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF501Q96CX3 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF501Q96CX3 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF501Q96CX3 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF501Q96CX3 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF501Q96CX3 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF501Q96CX3 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF501Q96CX3 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF501Q96CX3 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF501Q96CX3 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF501Q96CX3 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF501Q96CX3 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF501Q96CX3 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF501Q96CX3 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF501Q96CX3 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF501Q96CX3 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF501Q96CX3 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF501Q96CX3 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF501Q96CX3 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF501Q96CX3 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF501Q96CX3 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF501Q96CX3 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF501Q96CX3 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF501Q96CX3 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF501Q96CX3 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF501Q96CX3 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF501Q96CX3 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF501Q96CX3 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF501Q96CX3 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF501Q96CX3 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF501Q96CX3 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF501Q96CX3 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF501Q96CX3 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF501Q96CX3 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF501Q96CX3 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF501Q96CX3 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF501Q96CX3 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF501Q96CX3 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF501Q96CX3 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF501Q96CX3 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF501Q96CX3 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF501Q96CX3 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF501Q96CX3 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms