Protein–RNA interactions for Protein: Q969S2

NEIL2, Endonuclease 8-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL2Q969S2 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NEIL2Q969S2 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEIL2Q969S2 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEIL2Q969S2 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEIL2Q969S2 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEIL2Q969S2 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEIL2Q969S2 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEIL2Q969S2 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEIL2Q969S2 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NEIL2Q969S2 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEIL2Q969S2 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEIL2Q969S2 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEIL2Q969S2 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEIL2Q969S2 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEIL2Q969S2 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NEIL2Q969S2 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEIL2Q969S2 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEIL2Q969S2 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEIL2Q969S2 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEIL2Q969S2 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEIL2Q969S2 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEIL2Q969S2 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEIL2Q969S2 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEIL2Q969S2 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEIL2Q969S2 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEIL2Q969S2 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEIL2Q969S2 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEIL2Q969S2 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEIL2Q969S2 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NEIL2Q969S2 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEIL2Q969S2 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEIL2Q969S2 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NEIL2Q969S2 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEIL2Q969S2 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEIL2Q969S2 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEIL2Q969S2 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEIL2Q969S2 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEIL2Q969S2 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NEIL2Q969S2 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEIL2Q969S2 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEIL2Q969S2 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEIL2Q969S2 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEIL2Q969S2 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEIL2Q969S2 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEIL2Q969S2 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEIL2Q969S2 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEIL2Q969S2 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEIL2Q969S2 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEIL2Q969S2 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEIL2Q969S2 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
NEIL2Q969S2 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEIL2Q969S2 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEIL2Q969S2 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEIL2Q969S2 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEIL2Q969S2 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEIL2Q969S2 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEIL2Q969S2 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEIL2Q969S2 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEIL2Q969S2 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEIL2Q969S2 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEIL2Q969S2 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEIL2Q969S2 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEIL2Q969S2 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEIL2Q969S2 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
NEIL2Q969S2 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEIL2Q969S2 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEIL2Q969S2 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEIL2Q969S2 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEIL2Q969S2 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEIL2Q969S2 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEIL2Q969S2 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEIL2Q969S2 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NEIL2Q969S2 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEIL2Q969S2 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEIL2Q969S2 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEIL2Q969S2 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEIL2Q969S2 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NEIL2Q969S2 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NEIL2Q969S2 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEIL2Q969S2 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEIL2Q969S2 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEIL2Q969S2 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEIL2Q969S2 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEIL2Q969S2 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEIL2Q969S2 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEIL2Q969S2 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NEIL2Q969S2 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEIL2Q969S2 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEIL2Q969S2 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEIL2Q969S2 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEIL2Q969S2 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEIL2Q969S2 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEIL2Q969S2 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEIL2Q969S2 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEIL2Q969S2 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEIL2Q969S2 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEIL2Q969S2 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
NEIL2Q969S2 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEIL2Q969S2 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEIL2Q969S2 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms