Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ74

CTTNBP2, Cortactin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2Q8WZ74 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CTTNBP2Q8WZ74 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CTTNBP2Q8WZ74 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CTTNBP2Q8WZ74 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
CTTNBP2Q8WZ74 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CTTNBP2Q8WZ74 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
CTTNBP2Q8WZ74 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CTTNBP2Q8WZ74 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CTTNBP2Q8WZ74 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CTTNBP2Q8WZ74 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CTTNBP2Q8WZ74 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CTTNBP2Q8WZ74 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CTTNBP2Q8WZ74 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CTTNBP2Q8WZ74 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CTTNBP2Q8WZ74 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
CTTNBP2Q8WZ74 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CTTNBP2Q8WZ74 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
CTTNBP2Q8WZ74 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CTTNBP2Q8WZ74 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CTTNBP2Q8WZ74 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CTTNBP2Q8WZ74 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CTTNBP2Q8WZ74 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CTTNBP2Q8WZ74 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CTTNBP2Q8WZ74 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CTTNBP2Q8WZ74 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CTTNBP2Q8WZ74 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
CTTNBP2Q8WZ74 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CTTNBP2Q8WZ74 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CTTNBP2Q8WZ74 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CTTNBP2Q8WZ74 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CTTNBP2Q8WZ74 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CTTNBP2Q8WZ74 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CTTNBP2Q8WZ74 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CTTNBP2Q8WZ74 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CTTNBP2Q8WZ74 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CTTNBP2Q8WZ74 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CTTNBP2Q8WZ74 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CTTNBP2Q8WZ74 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CTTNBP2Q8WZ74 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CTTNBP2Q8WZ74 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CTTNBP2Q8WZ74 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
CTTNBP2Q8WZ74 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
CTTNBP2Q8WZ74 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CTTNBP2Q8WZ74 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CTTNBP2Q8WZ74 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CTTNBP2Q8WZ74 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CTTNBP2Q8WZ74 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CTTNBP2Q8WZ74 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CTTNBP2Q8WZ74 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CTTNBP2Q8WZ74 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CTTNBP2Q8WZ74 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CTTNBP2Q8WZ74 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CTTNBP2Q8WZ74 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CTTNBP2Q8WZ74 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CTTNBP2Q8WZ74 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CTTNBP2Q8WZ74 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CTTNBP2Q8WZ74 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CTTNBP2Q8WZ74 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CTTNBP2Q8WZ74 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CTTNBP2Q8WZ74 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CTTNBP2Q8WZ74 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CTTNBP2Q8WZ74 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CTTNBP2Q8WZ74 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
CTTNBP2Q8WZ74 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CTTNBP2Q8WZ74 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CTTNBP2Q8WZ74 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CTTNBP2Q8WZ74 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CTTNBP2Q8WZ74 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CTTNBP2Q8WZ74 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CTTNBP2Q8WZ74 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CTTNBP2Q8WZ74 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
CTTNBP2Q8WZ74 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CTTNBP2Q8WZ74 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CTTNBP2Q8WZ74 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CTTNBP2Q8WZ74 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
CTTNBP2Q8WZ74 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
CTTNBP2Q8WZ74 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CTTNBP2Q8WZ74 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CTTNBP2Q8WZ74 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CTTNBP2Q8WZ74 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
CTTNBP2Q8WZ74 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
CTTNBP2Q8WZ74 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CTTNBP2Q8WZ74 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.41
CTTNBP2Q8WZ74 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.41
CTTNBP2Q8WZ74 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.41
CTTNBP2Q8WZ74 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC30.07■■■□□ 2.41
CTTNBP2Q8WZ74 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC30.07■■■□□ 2.41
CTTNBP2Q8WZ74 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.41
CTTNBP2Q8WZ74 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.41
CTTNBP2Q8WZ74 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.41
CTTNBP2Q8WZ74 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.41
CTTNBP2Q8WZ74 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CTTNBP2Q8WZ74 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CTTNBP2Q8WZ74 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
CTTNBP2Q8WZ74 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CTTNBP2Q8WZ74 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CTTNBP2Q8WZ74 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CTTNBP2Q8WZ74 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
CTTNBP2Q8WZ74 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CTTNBP2Q8WZ74 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms