Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXU2

DNAAF4, Dynein assembly factor 4, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF4Q8WXU2 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DNAAF4Q8WXU2 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DNAAF4Q8WXU2 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DNAAF4Q8WXU2 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DNAAF4Q8WXU2 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DNAAF4Q8WXU2 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DNAAF4Q8WXU2 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DNAAF4Q8WXU2 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DNAAF4Q8WXU2 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DNAAF4Q8WXU2 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DNAAF4Q8WXU2 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DNAAF4Q8WXU2 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
DNAAF4Q8WXU2 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
DNAAF4Q8WXU2 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DNAAF4Q8WXU2 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DNAAF4Q8WXU2 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DNAAF4Q8WXU2 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DNAAF4Q8WXU2 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DNAAF4Q8WXU2 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DNAAF4Q8WXU2 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DNAAF4Q8WXU2 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DNAAF4Q8WXU2 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DNAAF4Q8WXU2 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DNAAF4Q8WXU2 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DNAAF4Q8WXU2 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DNAAF4Q8WXU2 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DNAAF4Q8WXU2 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DNAAF4Q8WXU2 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DNAAF4Q8WXU2 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DNAAF4Q8WXU2 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DNAAF4Q8WXU2 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DNAAF4Q8WXU2 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DNAAF4Q8WXU2 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DNAAF4Q8WXU2 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DNAAF4Q8WXU2 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DNAAF4Q8WXU2 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DNAAF4Q8WXU2 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DNAAF4Q8WXU2 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DNAAF4Q8WXU2 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DNAAF4Q8WXU2 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DNAAF4Q8WXU2 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DNAAF4Q8WXU2 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DNAAF4Q8WXU2 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DNAAF4Q8WXU2 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DNAAF4Q8WXU2 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DNAAF4Q8WXU2 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DNAAF4Q8WXU2 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DNAAF4Q8WXU2 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DNAAF4Q8WXU2 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DNAAF4Q8WXU2 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DNAAF4Q8WXU2 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DNAAF4Q8WXU2 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DNAAF4Q8WXU2 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DNAAF4Q8WXU2 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DNAAF4Q8WXU2 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DNAAF4Q8WXU2 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DNAAF4Q8WXU2 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DNAAF4Q8WXU2 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DNAAF4Q8WXU2 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DNAAF4Q8WXU2 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DNAAF4Q8WXU2 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DNAAF4Q8WXU2 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DNAAF4Q8WXU2 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DNAAF4Q8WXU2 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DNAAF4Q8WXU2 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DNAAF4Q8WXU2 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DNAAF4Q8WXU2 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
DNAAF4Q8WXU2 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DNAAF4Q8WXU2 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
DNAAF4Q8WXU2 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DNAAF4Q8WXU2 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DNAAF4Q8WXU2 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DNAAF4Q8WXU2 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DNAAF4Q8WXU2 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DNAAF4Q8WXU2 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DNAAF4Q8WXU2 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DNAAF4Q8WXU2 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DNAAF4Q8WXU2 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DNAAF4Q8WXU2 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DNAAF4Q8WXU2 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DNAAF4Q8WXU2 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DNAAF4Q8WXU2 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DNAAF4Q8WXU2 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DNAAF4Q8WXU2 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DNAAF4Q8WXU2 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DNAAF4Q8WXU2 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DNAAF4Q8WXU2 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DNAAF4Q8WXU2 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DNAAF4Q8WXU2 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DNAAF4Q8WXU2 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DNAAF4Q8WXU2 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DNAAF4Q8WXU2 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DNAAF4Q8WXU2 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DNAAF4Q8WXU2 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DNAAF4Q8WXU2 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DNAAF4Q8WXU2 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DNAAF4Q8WXU2 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DNAAF4Q8WXU2 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DNAAF4Q8WXU2 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DNAAF4Q8WXU2 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms