Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWI1

LMO7, LIM domain only protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO7Q8WWI1 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LMO7Q8WWI1 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LMO7Q8WWI1 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
LMO7Q8WWI1 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
LMO7Q8WWI1 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
LMO7Q8WWI1 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
LMO7Q8WWI1 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
LMO7Q8WWI1 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
LMO7Q8WWI1 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
LMO7Q8WWI1 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LMO7Q8WWI1 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LMO7Q8WWI1 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LMO7Q8WWI1 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LMO7Q8WWI1 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LMO7Q8WWI1 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LMO7Q8WWI1 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LMO7Q8WWI1 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LMO7Q8WWI1 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LMO7Q8WWI1 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LMO7Q8WWI1 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LMO7Q8WWI1 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LMO7Q8WWI1 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LMO7Q8WWI1 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
LMO7Q8WWI1 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LMO7Q8WWI1 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
LMO7Q8WWI1 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LMO7Q8WWI1 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LMO7Q8WWI1 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LMO7Q8WWI1 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LMO7Q8WWI1 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LMO7Q8WWI1 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMO7Q8WWI1 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMO7Q8WWI1 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMO7Q8WWI1 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMO7Q8WWI1 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMO7Q8WWI1 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
LMO7Q8WWI1 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMO7Q8WWI1 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMO7Q8WWI1 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
LMO7Q8WWI1 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMO7Q8WWI1 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
LMO7Q8WWI1 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMO7Q8WWI1 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMO7Q8WWI1 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMO7Q8WWI1 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMO7Q8WWI1 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMO7Q8WWI1 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMO7Q8WWI1 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMO7Q8WWI1 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMO7Q8WWI1 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMO7Q8WWI1 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMO7Q8WWI1 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMO7Q8WWI1 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMO7Q8WWI1 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMO7Q8WWI1 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMO7Q8WWI1 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMO7Q8WWI1 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMO7Q8WWI1 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
LMO7Q8WWI1 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
LMO7Q8WWI1 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMO7Q8WWI1 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMO7Q8WWI1 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMO7Q8WWI1 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMO7Q8WWI1 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMO7Q8WWI1 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMO7Q8WWI1 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMO7Q8WWI1 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
LMO7Q8WWI1 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMO7Q8WWI1 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMO7Q8WWI1 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMO7Q8WWI1 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
LMO7Q8WWI1 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMO7Q8WWI1 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
LMO7Q8WWI1 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LMO7Q8WWI1 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LMO7Q8WWI1 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
LMO7Q8WWI1 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LMO7Q8WWI1 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
LMO7Q8WWI1 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
LMO7Q8WWI1 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
LMO7Q8WWI1 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LMO7Q8WWI1 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LMO7Q8WWI1 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LMO7Q8WWI1 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
LMO7Q8WWI1 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LMO7Q8WWI1 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LMO7Q8WWI1 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LMO7Q8WWI1 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
LMO7Q8WWI1 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LMO7Q8WWI1 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LMO7Q8WWI1 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMO7Q8WWI1 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMO7Q8WWI1 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMO7Q8WWI1 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMO7Q8WWI1 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMO7Q8WWI1 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMO7Q8WWI1 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMO7Q8WWI1 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMO7Q8WWI1 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
LMO7Q8WWI1 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms