Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEDD1Q8NHV4 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEDD1Q8NHV4 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEDD1Q8NHV4 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEDD1Q8NHV4 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEDD1Q8NHV4 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEDD1Q8NHV4 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEDD1Q8NHV4 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEDD1Q8NHV4 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEDD1Q8NHV4 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEDD1Q8NHV4 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEDD1Q8NHV4 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEDD1Q8NHV4 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NEDD1Q8NHV4 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEDD1Q8NHV4 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEDD1Q8NHV4 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEDD1Q8NHV4 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEDD1Q8NHV4 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEDD1Q8NHV4 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEDD1Q8NHV4 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEDD1Q8NHV4 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEDD1Q8NHV4 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NEDD1Q8NHV4 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEDD1Q8NHV4 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEDD1Q8NHV4 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEDD1Q8NHV4 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEDD1Q8NHV4 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEDD1Q8NHV4 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEDD1Q8NHV4 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEDD1Q8NHV4 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEDD1Q8NHV4 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEDD1Q8NHV4 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEDD1Q8NHV4 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEDD1Q8NHV4 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEDD1Q8NHV4 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEDD1Q8NHV4 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEDD1Q8NHV4 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEDD1Q8NHV4 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEDD1Q8NHV4 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEDD1Q8NHV4 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEDD1Q8NHV4 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEDD1Q8NHV4 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NEDD1Q8NHV4 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NEDD1Q8NHV4 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NEDD1Q8NHV4 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NEDD1Q8NHV4 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NEDD1Q8NHV4 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NEDD1Q8NHV4 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
NEDD1Q8NHV4 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NEDD1Q8NHV4 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NEDD1Q8NHV4 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NEDD1Q8NHV4 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NEDD1Q8NHV4 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NEDD1Q8NHV4 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NEDD1Q8NHV4 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NEDD1Q8NHV4 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NEDD1Q8NHV4 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NEDD1Q8NHV4 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NEDD1Q8NHV4 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NEDD1Q8NHV4 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NEDD1Q8NHV4 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NEDD1Q8NHV4 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NEDD1Q8NHV4 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NEDD1Q8NHV4 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
NEDD1Q8NHV4 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NEDD1Q8NHV4 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
NEDD1Q8NHV4 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
NEDD1Q8NHV4 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NEDD1Q8NHV4 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NEDD1Q8NHV4 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NEDD1Q8NHV4 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NEDD1Q8NHV4 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NEDD1Q8NHV4 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NEDD1Q8NHV4 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NEDD1Q8NHV4 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NEDD1Q8NHV4 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NEDD1Q8NHV4 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NEDD1Q8NHV4 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEDD1Q8NHV4 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEDD1Q8NHV4 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEDD1Q8NHV4 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEDD1Q8NHV4 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEDD1Q8NHV4 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEDD1Q8NHV4 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NEDD1Q8NHV4 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEDD1Q8NHV4 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEDD1Q8NHV4 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEDD1Q8NHV4 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEDD1Q8NHV4 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEDD1Q8NHV4 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEDD1Q8NHV4 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEDD1Q8NHV4 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEDD1Q8NHV4 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEDD1Q8NHV4 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NEDD1Q8NHV4 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NEDD1Q8NHV4 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEDD1Q8NHV4 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEDD1Q8NHV4 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEDD1Q8NHV4 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEDD1Q8NHV4 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms