Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEW7

TMIE, Transmembrane inner ear expressed protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIEQ8NEW7 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMIEQ8NEW7 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMIEQ8NEW7 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMIEQ8NEW7 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMIEQ8NEW7 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
TMIEQ8NEW7 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMIEQ8NEW7 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMIEQ8NEW7 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMIEQ8NEW7 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMIEQ8NEW7 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMIEQ8NEW7 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMIEQ8NEW7 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMIEQ8NEW7 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMIEQ8NEW7 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMIEQ8NEW7 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMIEQ8NEW7 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMIEQ8NEW7 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMIEQ8NEW7 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMIEQ8NEW7 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMIEQ8NEW7 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMIEQ8NEW7 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMIEQ8NEW7 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMIEQ8NEW7 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMIEQ8NEW7 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMIEQ8NEW7 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMIEQ8NEW7 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMIEQ8NEW7 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMIEQ8NEW7 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMIEQ8NEW7 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMIEQ8NEW7 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMIEQ8NEW7 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMIEQ8NEW7 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMIEQ8NEW7 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
TMIEQ8NEW7 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMIEQ8NEW7 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMIEQ8NEW7 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMIEQ8NEW7 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMIEQ8NEW7 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMIEQ8NEW7 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMIEQ8NEW7 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMIEQ8NEW7 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMIEQ8NEW7 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMIEQ8NEW7 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMIEQ8NEW7 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMIEQ8NEW7 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMIEQ8NEW7 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMIEQ8NEW7 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
TMIEQ8NEW7 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
TMIEQ8NEW7 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMIEQ8NEW7 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMIEQ8NEW7 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMIEQ8NEW7 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMIEQ8NEW7 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMIEQ8NEW7 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMIEQ8NEW7 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMIEQ8NEW7 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMIEQ8NEW7 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMIEQ8NEW7 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMIEQ8NEW7 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMIEQ8NEW7 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMIEQ8NEW7 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMIEQ8NEW7 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMIEQ8NEW7 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMIEQ8NEW7 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMIEQ8NEW7 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
TMIEQ8NEW7 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMIEQ8NEW7 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMIEQ8NEW7 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMIEQ8NEW7 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMIEQ8NEW7 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMIEQ8NEW7 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMIEQ8NEW7 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMIEQ8NEW7 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMIEQ8NEW7 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMIEQ8NEW7 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMIEQ8NEW7 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMIEQ8NEW7 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMIEQ8NEW7 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMIEQ8NEW7 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMIEQ8NEW7 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMIEQ8NEW7 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMIEQ8NEW7 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
TMIEQ8NEW7 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMIEQ8NEW7 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMIEQ8NEW7 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMIEQ8NEW7 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMIEQ8NEW7 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMIEQ8NEW7 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
TMIEQ8NEW7 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMIEQ8NEW7 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMIEQ8NEW7 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMIEQ8NEW7 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMIEQ8NEW7 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMIEQ8NEW7 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMIEQ8NEW7 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMIEQ8NEW7 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMIEQ8NEW7 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMIEQ8NEW7 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMIEQ8NEW7 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMIEQ8NEW7 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms