Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF3

CCDC112, Coiled-coil domain-containing protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC112Q8NEF3 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC112Q8NEF3 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC112Q8NEF3 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC112Q8NEF3 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC112Q8NEF3 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC112Q8NEF3 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC112Q8NEF3 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC112Q8NEF3 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC112Q8NEF3 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC112Q8NEF3 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC112Q8NEF3 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC112Q8NEF3 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC112Q8NEF3 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC112Q8NEF3 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC112Q8NEF3 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC112Q8NEF3 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC112Q8NEF3 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC112Q8NEF3 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC112Q8NEF3 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC112Q8NEF3 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC112Q8NEF3 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC112Q8NEF3 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC112Q8NEF3 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC112Q8NEF3 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC112Q8NEF3 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC112Q8NEF3 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC112Q8NEF3 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC112Q8NEF3 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC112Q8NEF3 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC112Q8NEF3 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC112Q8NEF3 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC112Q8NEF3 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC112Q8NEF3 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC112Q8NEF3 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC112Q8NEF3 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC112Q8NEF3 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC112Q8NEF3 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC112Q8NEF3 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC112Q8NEF3 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC112Q8NEF3 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC112Q8NEF3 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC112Q8NEF3 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC112Q8NEF3 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC112Q8NEF3 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC112Q8NEF3 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC112Q8NEF3 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC112Q8NEF3 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC112Q8NEF3 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC112Q8NEF3 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC112Q8NEF3 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC112Q8NEF3 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC112Q8NEF3 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC112Q8NEF3 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC112Q8NEF3 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC112Q8NEF3 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC112Q8NEF3 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC112Q8NEF3 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC112Q8NEF3 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC112Q8NEF3 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC112Q8NEF3 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC112Q8NEF3 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC112Q8NEF3 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC112Q8NEF3 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC112Q8NEF3 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC112Q8NEF3 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC112Q8NEF3 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC112Q8NEF3 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC112Q8NEF3 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC112Q8NEF3 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC112Q8NEF3 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC112Q8NEF3 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC112Q8NEF3 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC112Q8NEF3 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC112Q8NEF3 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC112Q8NEF3 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC112Q8NEF3 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC112Q8NEF3 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC112Q8NEF3 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC112Q8NEF3 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC112Q8NEF3 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC112Q8NEF3 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC112Q8NEF3 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC112Q8NEF3 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC112Q8NEF3 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC112Q8NEF3 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC112Q8NEF3 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC112Q8NEF3 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC112Q8NEF3 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC112Q8NEF3 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC112Q8NEF3 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC112Q8NEF3 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC112Q8NEF3 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC112Q8NEF3 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC112Q8NEF3 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC112Q8NEF3 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC112Q8NEF3 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC112Q8NEF3 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC112Q8NEF3 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC112Q8NEF3 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CCDC112Q8NEF3 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms