Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBF6

AVL9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AVL9Q8NBF6 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
AVL9Q8NBF6 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
AVL9Q8NBF6 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AVL9Q8NBF6 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AVL9Q8NBF6 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
AVL9Q8NBF6 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
AVL9Q8NBF6 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
AVL9Q8NBF6 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
AVL9Q8NBF6 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
AVL9Q8NBF6 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
AVL9Q8NBF6 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
AVL9Q8NBF6 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AVL9Q8NBF6 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
AVL9Q8NBF6 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AVL9Q8NBF6 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AVL9Q8NBF6 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AVL9Q8NBF6 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
AVL9Q8NBF6 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
AVL9Q8NBF6 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AVL9Q8NBF6 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AVL9Q8NBF6 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AVL9Q8NBF6 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
AVL9Q8NBF6 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AVL9Q8NBF6 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
AVL9Q8NBF6 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AVL9Q8NBF6 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AVL9Q8NBF6 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AVL9Q8NBF6 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AVL9Q8NBF6 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AVL9Q8NBF6 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
AVL9Q8NBF6 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
AVL9Q8NBF6 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
AVL9Q8NBF6 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
AVL9Q8NBF6 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
AVL9Q8NBF6 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AVL9Q8NBF6 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
AVL9Q8NBF6 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
AVL9Q8NBF6 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
AVL9Q8NBF6 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
AVL9Q8NBF6 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
AVL9Q8NBF6 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
AVL9Q8NBF6 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AVL9Q8NBF6 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
AVL9Q8NBF6 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
AVL9Q8NBF6 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AVL9Q8NBF6 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AVL9Q8NBF6 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AVL9Q8NBF6 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AVL9Q8NBF6 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
AVL9Q8NBF6 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
AVL9Q8NBF6 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
AVL9Q8NBF6 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
AVL9Q8NBF6 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
AVL9Q8NBF6 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
AVL9Q8NBF6 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
AVL9Q8NBF6 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
AVL9Q8NBF6 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
AVL9Q8NBF6 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
AVL9Q8NBF6 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
AVL9Q8NBF6 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
AVL9Q8NBF6 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
AVL9Q8NBF6 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
AVL9Q8NBF6 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
AVL9Q8NBF6 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
AVL9Q8NBF6 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
AVL9Q8NBF6 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
AVL9Q8NBF6 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
AVL9Q8NBF6 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
AVL9Q8NBF6 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
AVL9Q8NBF6 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
AVL9Q8NBF6 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
AVL9Q8NBF6 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
AVL9Q8NBF6 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AVL9Q8NBF6 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AVL9Q8NBF6 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AVL9Q8NBF6 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AVL9Q8NBF6 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AVL9Q8NBF6 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
AVL9Q8NBF6 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AVL9Q8NBF6 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
AVL9Q8NBF6 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
AVL9Q8NBF6 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
AVL9Q8NBF6 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
AVL9Q8NBF6 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
AVL9Q8NBF6 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
AVL9Q8NBF6 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
AVL9Q8NBF6 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
AVL9Q8NBF6 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AVL9Q8NBF6 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AVL9Q8NBF6 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AVL9Q8NBF6 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
AVL9Q8NBF6 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AVL9Q8NBF6 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AVL9Q8NBF6 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AVL9Q8NBF6 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AVL9Q8NBF6 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AVL9Q8NBF6 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AVL9Q8NBF6 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AVL9Q8NBF6 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AVL9Q8NBF6 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms