Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA47

CCDC63, Coiled-coil domain-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC63Q8NA47 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC63Q8NA47 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC63Q8NA47 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC63Q8NA47 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC63Q8NA47 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC63Q8NA47 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC63Q8NA47 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC63Q8NA47 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC63Q8NA47 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC63Q8NA47 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC63Q8NA47 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC63Q8NA47 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC63Q8NA47 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC63Q8NA47 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC63Q8NA47 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC63Q8NA47 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC63Q8NA47 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC63Q8NA47 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC63Q8NA47 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC63Q8NA47 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC63Q8NA47 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC63Q8NA47 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC63Q8NA47 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC63Q8NA47 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC63Q8NA47 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC63Q8NA47 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC63Q8NA47 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC63Q8NA47 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC63Q8NA47 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC63Q8NA47 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC63Q8NA47 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC63Q8NA47 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC63Q8NA47 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC63Q8NA47 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC63Q8NA47 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC63Q8NA47 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC63Q8NA47 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC63Q8NA47 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC63Q8NA47 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC63Q8NA47 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC63Q8NA47 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC63Q8NA47 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC63Q8NA47 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC63Q8NA47 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC63Q8NA47 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC63Q8NA47 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC63Q8NA47 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC63Q8NA47 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC63Q8NA47 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC63Q8NA47 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC63Q8NA47 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC63Q8NA47 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC63Q8NA47 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC63Q8NA47 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC63Q8NA47 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC63Q8NA47 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC63Q8NA47 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC63Q8NA47 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC63Q8NA47 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC63Q8NA47 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC63Q8NA47 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC63Q8NA47 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC63Q8NA47 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC63Q8NA47 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC63Q8NA47 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CCDC63Q8NA47 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CCDC63Q8NA47 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CCDC63Q8NA47 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC63Q8NA47 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC63Q8NA47 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC63Q8NA47 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC63Q8NA47 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC63Q8NA47 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC63Q8NA47 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC63Q8NA47 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC63Q8NA47 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC63Q8NA47 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC63Q8NA47 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC63Q8NA47 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC63Q8NA47 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC63Q8NA47 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC63Q8NA47 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC63Q8NA47 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC63Q8NA47 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC63Q8NA47 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC63Q8NA47 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC63Q8NA47 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC63Q8NA47 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC63Q8NA47 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC63Q8NA47 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC63Q8NA47 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC63Q8NA47 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC63Q8NA47 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC63Q8NA47 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC63Q8NA47 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC63Q8NA47 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC63Q8NA47 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC63Q8NA47 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC63Q8NA47 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC63Q8NA47 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms