Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9L1

ZIC4, Zinc finger protein ZIC 4, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC4Q8N9L1 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZIC4Q8N9L1 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZIC4Q8N9L1 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ZIC4Q8N9L1 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ZIC4Q8N9L1 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ZIC4Q8N9L1 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ZIC4Q8N9L1 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZIC4Q8N9L1 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZIC4Q8N9L1 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZIC4Q8N9L1 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZIC4Q8N9L1 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZIC4Q8N9L1 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZIC4Q8N9L1 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZIC4Q8N9L1 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZIC4Q8N9L1 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZIC4Q8N9L1 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZIC4Q8N9L1 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZIC4Q8N9L1 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZIC4Q8N9L1 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZIC4Q8N9L1 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZIC4Q8N9L1 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZIC4Q8N9L1 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZIC4Q8N9L1 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZIC4Q8N9L1 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZIC4Q8N9L1 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZIC4Q8N9L1 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ZIC4Q8N9L1 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZIC4Q8N9L1 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZIC4Q8N9L1 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZIC4Q8N9L1 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZIC4Q8N9L1 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZIC4Q8N9L1 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZIC4Q8N9L1 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZIC4Q8N9L1 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZIC4Q8N9L1 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZIC4Q8N9L1 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZIC4Q8N9L1 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZIC4Q8N9L1 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ZIC4Q8N9L1 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZIC4Q8N9L1 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZIC4Q8N9L1 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZIC4Q8N9L1 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZIC4Q8N9L1 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZIC4Q8N9L1 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZIC4Q8N9L1 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZIC4Q8N9L1 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZIC4Q8N9L1 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZIC4Q8N9L1 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZIC4Q8N9L1 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZIC4Q8N9L1 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZIC4Q8N9L1 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZIC4Q8N9L1 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ZIC4Q8N9L1 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZIC4Q8N9L1 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZIC4Q8N9L1 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZIC4Q8N9L1 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZIC4Q8N9L1 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZIC4Q8N9L1 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZIC4Q8N9L1 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZIC4Q8N9L1 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZIC4Q8N9L1 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZIC4Q8N9L1 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZIC4Q8N9L1 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZIC4Q8N9L1 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZIC4Q8N9L1 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZIC4Q8N9L1 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ZIC4Q8N9L1 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ZIC4Q8N9L1 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZIC4Q8N9L1 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZIC4Q8N9L1 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZIC4Q8N9L1 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZIC4Q8N9L1 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZIC4Q8N9L1 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZIC4Q8N9L1 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZIC4Q8N9L1 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZIC4Q8N9L1 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZIC4Q8N9L1 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZIC4Q8N9L1 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZIC4Q8N9L1 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZIC4Q8N9L1 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZIC4Q8N9L1 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZIC4Q8N9L1 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZIC4Q8N9L1 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZIC4Q8N9L1 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZIC4Q8N9L1 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZIC4Q8N9L1 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZIC4Q8N9L1 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZIC4Q8N9L1 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZIC4Q8N9L1 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZIC4Q8N9L1 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZIC4Q8N9L1 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZIC4Q8N9L1 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZIC4Q8N9L1 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ZIC4Q8N9L1 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZIC4Q8N9L1 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZIC4Q8N9L1 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZIC4Q8N9L1 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZIC4Q8N9L1 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZIC4Q8N9L1 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZIC4Q8N9L1 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms