Protein–RNA interactions for Protein: Q8N205

SYNE4, Nesprin-4, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4Q8N205 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYNE4Q8N205 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYNE4Q8N205 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYNE4Q8N205 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYNE4Q8N205 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYNE4Q8N205 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYNE4Q8N205 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYNE4Q8N205 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYNE4Q8N205 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYNE4Q8N205 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SYNE4Q8N205 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYNE4Q8N205 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYNE4Q8N205 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYNE4Q8N205 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYNE4Q8N205 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYNE4Q8N205 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYNE4Q8N205 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYNE4Q8N205 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYNE4Q8N205 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYNE4Q8N205 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYNE4Q8N205 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SYNE4Q8N205 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SYNE4Q8N205 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYNE4Q8N205 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SYNE4Q8N205 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYNE4Q8N205 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYNE4Q8N205 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYNE4Q8N205 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYNE4Q8N205 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYNE4Q8N205 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYNE4Q8N205 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYNE4Q8N205 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYNE4Q8N205 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYNE4Q8N205 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYNE4Q8N205 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYNE4Q8N205 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYNE4Q8N205 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SYNE4Q8N205 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYNE4Q8N205 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYNE4Q8N205 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SYNE4Q8N205 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYNE4Q8N205 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYNE4Q8N205 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYNE4Q8N205 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYNE4Q8N205 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYNE4Q8N205 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYNE4Q8N205 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYNE4Q8N205 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYNE4Q8N205 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYNE4Q8N205 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYNE4Q8N205 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYNE4Q8N205 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYNE4Q8N205 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYNE4Q8N205 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SYNE4Q8N205 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYNE4Q8N205 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYNE4Q8N205 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SYNE4Q8N205 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SYNE4Q8N205 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SYNE4Q8N205 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SYNE4Q8N205 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYNE4Q8N205 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYNE4Q8N205 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYNE4Q8N205 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYNE4Q8N205 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYNE4Q8N205 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYNE4Q8N205 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYNE4Q8N205 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYNE4Q8N205 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYNE4Q8N205 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYNE4Q8N205 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYNE4Q8N205 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYNE4Q8N205 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYNE4Q8N205 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYNE4Q8N205 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SYNE4Q8N205 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYNE4Q8N205 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYNE4Q8N205 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYNE4Q8N205 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYNE4Q8N205 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYNE4Q8N205 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYNE4Q8N205 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYNE4Q8N205 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYNE4Q8N205 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYNE4Q8N205 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYNE4Q8N205 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYNE4Q8N205 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYNE4Q8N205 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYNE4Q8N205 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYNE4Q8N205 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYNE4Q8N205 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYNE4Q8N205 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYNE4Q8N205 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYNE4Q8N205 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SYNE4Q8N205 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYNE4Q8N205 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYNE4Q8N205 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYNE4Q8N205 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SYNE4Q8N205 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SYNE4Q8N205 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms