Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5U6

WDR53, WD repeat-containing protein 53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR53Q7Z5U6 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms