Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z408

CSMD2, CUB and sushi domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSMD2Q7Z408 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSMD2Q7Z408 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSMD2Q7Z408 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSMD2Q7Z408 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSMD2Q7Z408 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CSMD2Q7Z408 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSMD2Q7Z408 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSMD2Q7Z408 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSMD2Q7Z408 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSMD2Q7Z408 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSMD2Q7Z408 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSMD2Q7Z408 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSMD2Q7Z408 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSMD2Q7Z408 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSMD2Q7Z408 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSMD2Q7Z408 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSMD2Q7Z408 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSMD2Q7Z408 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSMD2Q7Z408 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSMD2Q7Z408 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSMD2Q7Z408 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSMD2Q7Z408 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSMD2Q7Z408 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSMD2Q7Z408 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSMD2Q7Z408 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSMD2Q7Z408 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSMD2Q7Z408 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSMD2Q7Z408 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSMD2Q7Z408 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CSMD2Q7Z408 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSMD2Q7Z408 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSMD2Q7Z408 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSMD2Q7Z408 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSMD2Q7Z408 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSMD2Q7Z408 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSMD2Q7Z408 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSMD2Q7Z408 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSMD2Q7Z408 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CSMD2Q7Z408 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSMD2Q7Z408 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSMD2Q7Z408 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSMD2Q7Z408 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSMD2Q7Z408 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSMD2Q7Z408 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSMD2Q7Z408 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CSMD2Q7Z408 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSMD2Q7Z408 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSMD2Q7Z408 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSMD2Q7Z408 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSMD2Q7Z408 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSMD2Q7Z408 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSMD2Q7Z408 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSMD2Q7Z408 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSMD2Q7Z408 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSMD2Q7Z408 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSMD2Q7Z408 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSMD2Q7Z408 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSMD2Q7Z408 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSMD2Q7Z408 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSMD2Q7Z408 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSMD2Q7Z408 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSMD2Q7Z408 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSMD2Q7Z408 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSMD2Q7Z408 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSMD2Q7Z408 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CSMD2Q7Z408 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSMD2Q7Z408 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSMD2Q7Z408 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSMD2Q7Z408 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSMD2Q7Z408 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSMD2Q7Z408 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSMD2Q7Z408 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSMD2Q7Z408 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSMD2Q7Z408 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSMD2Q7Z408 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSMD2Q7Z408 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSMD2Q7Z408 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSMD2Q7Z408 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSMD2Q7Z408 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CSMD2Q7Z408 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSMD2Q7Z408 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSMD2Q7Z408 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSMD2Q7Z408 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSMD2Q7Z408 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSMD2Q7Z408 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSMD2Q7Z408 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSMD2Q7Z408 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSMD2Q7Z408 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSMD2Q7Z408 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSMD2Q7Z408 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSMD2Q7Z408 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSMD2Q7Z408 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSMD2Q7Z408 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSMD2Q7Z408 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CSMD2Q7Z408 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CSMD2Q7Z408 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSMD2Q7Z408 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSMD2Q7Z408 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSMD2Q7Z408 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSMD2Q7Z408 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms