Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTF1AQ7RTS3 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTF1AQ7RTS3 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTF1AQ7RTS3 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTF1AQ7RTS3 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTF1AQ7RTS3 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTF1AQ7RTS3 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PTF1AQ7RTS3 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PTF1AQ7RTS3 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PTF1AQ7RTS3 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTF1AQ7RTS3 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PTF1AQ7RTS3 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PTF1AQ7RTS3 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTF1AQ7RTS3 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTF1AQ7RTS3 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PTF1AQ7RTS3 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTF1AQ7RTS3 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTF1AQ7RTS3 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTF1AQ7RTS3 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTF1AQ7RTS3 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTF1AQ7RTS3 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTF1AQ7RTS3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTF1AQ7RTS3 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTF1AQ7RTS3 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTF1AQ7RTS3 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTF1AQ7RTS3 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTF1AQ7RTS3 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTF1AQ7RTS3 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTF1AQ7RTS3 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTF1AQ7RTS3 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTF1AQ7RTS3 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PTF1AQ7RTS3 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PTF1AQ7RTS3 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTF1AQ7RTS3 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTF1AQ7RTS3 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTF1AQ7RTS3 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTF1AQ7RTS3 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTF1AQ7RTS3 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTF1AQ7RTS3 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTF1AQ7RTS3 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTF1AQ7RTS3 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTF1AQ7RTS3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTF1AQ7RTS3 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTF1AQ7RTS3 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTF1AQ7RTS3 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTF1AQ7RTS3 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTF1AQ7RTS3 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTF1AQ7RTS3 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTF1AQ7RTS3 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PTF1AQ7RTS3 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTF1AQ7RTS3 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTF1AQ7RTS3 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTF1AQ7RTS3 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTF1AQ7RTS3 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTF1AQ7RTS3 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTF1AQ7RTS3 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTF1AQ7RTS3 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTF1AQ7RTS3 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTF1AQ7RTS3 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTF1AQ7RTS3 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTF1AQ7RTS3 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTF1AQ7RTS3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTF1AQ7RTS3 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTF1AQ7RTS3 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTF1AQ7RTS3 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTF1AQ7RTS3 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTF1AQ7RTS3 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTF1AQ7RTS3 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTF1AQ7RTS3 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PTF1AQ7RTS3 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTF1AQ7RTS3 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTF1AQ7RTS3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTF1AQ7RTS3 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTF1AQ7RTS3 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTF1AQ7RTS3 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTF1AQ7RTS3 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTF1AQ7RTS3 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTF1AQ7RTS3 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTF1AQ7RTS3 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTF1AQ7RTS3 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTF1AQ7RTS3 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTF1AQ7RTS3 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTF1AQ7RTS3 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTF1AQ7RTS3 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTF1AQ7RTS3 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTF1AQ7RTS3 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTF1AQ7RTS3 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTF1AQ7RTS3 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTF1AQ7RTS3 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTF1AQ7RTS3 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTF1AQ7RTS3 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTF1AQ7RTS3 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTF1AQ7RTS3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTF1AQ7RTS3 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTF1AQ7RTS3 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTF1AQ7RTS3 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTF1AQ7RTS3 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTF1AQ7RTS3 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTF1AQ7RTS3 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTF1AQ7RTS3 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms