Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT52

FAM43B, Protein FAM43B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM43BQ6ZT52 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM43BQ6ZT52 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM43BQ6ZT52 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM43BQ6ZT52 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM43BQ6ZT52 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM43BQ6ZT52 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM43BQ6ZT52 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM43BQ6ZT52 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM43BQ6ZT52 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM43BQ6ZT52 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM43BQ6ZT52 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM43BQ6ZT52 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM43BQ6ZT52 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM43BQ6ZT52 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM43BQ6ZT52 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM43BQ6ZT52 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM43BQ6ZT52 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM43BQ6ZT52 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM43BQ6ZT52 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM43BQ6ZT52 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM43BQ6ZT52 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM43BQ6ZT52 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM43BQ6ZT52 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM43BQ6ZT52 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM43BQ6ZT52 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM43BQ6ZT52 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM43BQ6ZT52 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM43BQ6ZT52 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM43BQ6ZT52 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM43BQ6ZT52 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM43BQ6ZT52 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM43BQ6ZT52 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM43BQ6ZT52 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM43BQ6ZT52 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM43BQ6ZT52 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM43BQ6ZT52 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM43BQ6ZT52 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM43BQ6ZT52 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM43BQ6ZT52 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM43BQ6ZT52 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM43BQ6ZT52 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM43BQ6ZT52 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM43BQ6ZT52 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM43BQ6ZT52 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM43BQ6ZT52 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM43BQ6ZT52 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM43BQ6ZT52 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM43BQ6ZT52 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM43BQ6ZT52 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM43BQ6ZT52 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM43BQ6ZT52 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM43BQ6ZT52 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM43BQ6ZT52 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM43BQ6ZT52 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM43BQ6ZT52 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM43BQ6ZT52 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM43BQ6ZT52 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM43BQ6ZT52 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM43BQ6ZT52 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM43BQ6ZT52 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM43BQ6ZT52 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM43BQ6ZT52 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM43BQ6ZT52 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM43BQ6ZT52 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM43BQ6ZT52 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM43BQ6ZT52 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM43BQ6ZT52 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM43BQ6ZT52 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM43BQ6ZT52 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM43BQ6ZT52 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM43BQ6ZT52 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM43BQ6ZT52 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM43BQ6ZT52 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM43BQ6ZT52 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM43BQ6ZT52 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM43BQ6ZT52 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM43BQ6ZT52 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM43BQ6ZT52 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM43BQ6ZT52 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM43BQ6ZT52 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM43BQ6ZT52 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM43BQ6ZT52 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM43BQ6ZT52 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM43BQ6ZT52 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM43BQ6ZT52 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM43BQ6ZT52 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM43BQ6ZT52 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM43BQ6ZT52 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM43BQ6ZT52 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM43BQ6ZT52 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM43BQ6ZT52 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM43BQ6ZT52 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM43BQ6ZT52 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM43BQ6ZT52 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM43BQ6ZT52 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM43BQ6ZT52 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM43BQ6ZT52 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM43BQ6ZT52 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM43BQ6ZT52 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM43BQ6ZT52 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms