Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQN7

SLCO4C1, Solute carrier organic anion transporter family member 4C1, humanhuman

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO4C1Q6ZQN7 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLCO4C1Q6ZQN7 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLCO4C1Q6ZQN7 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLCO4C1Q6ZQN7 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLCO4C1Q6ZQN7 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLCO4C1Q6ZQN7 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SLCO4C1Q6ZQN7 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLCO4C1Q6ZQN7 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLCO4C1Q6ZQN7 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLCO4C1Q6ZQN7 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLCO4C1Q6ZQN7 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SLCO4C1Q6ZQN7 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLCO4C1Q6ZQN7 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SLCO4C1Q6ZQN7 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLCO4C1Q6ZQN7 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLCO4C1Q6ZQN7 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLCO4C1Q6ZQN7 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLCO4C1Q6ZQN7 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLCO4C1Q6ZQN7 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLCO4C1Q6ZQN7 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLCO4C1Q6ZQN7 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLCO4C1Q6ZQN7 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
SLCO4C1Q6ZQN7 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SLCO4C1Q6ZQN7 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SLCO4C1Q6ZQN7 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLCO4C1Q6ZQN7 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLCO4C1Q6ZQN7 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLCO4C1Q6ZQN7 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLCO4C1Q6ZQN7 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLCO4C1Q6ZQN7 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLCO4C1Q6ZQN7 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLCO4C1Q6ZQN7 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLCO4C1Q6ZQN7 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLCO4C1Q6ZQN7 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SLCO4C1Q6ZQN7 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLCO4C1Q6ZQN7 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLCO4C1Q6ZQN7 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLCO4C1Q6ZQN7 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLCO4C1Q6ZQN7 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLCO4C1Q6ZQN7 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SLCO4C1Q6ZQN7 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLCO4C1Q6ZQN7 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLCO4C1Q6ZQN7 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLCO4C1Q6ZQN7 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLCO4C1Q6ZQN7 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLCO4C1Q6ZQN7 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLCO4C1Q6ZQN7 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLCO4C1Q6ZQN7 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SLCO4C1Q6ZQN7 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLCO4C1Q6ZQN7 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLCO4C1Q6ZQN7 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLCO4C1Q6ZQN7 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLCO4C1Q6ZQN7 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLCO4C1Q6ZQN7 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SLCO4C1Q6ZQN7 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLCO4C1Q6ZQN7 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SLCO4C1Q6ZQN7 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SLCO4C1Q6ZQN7 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLCO4C1Q6ZQN7 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLCO4C1Q6ZQN7 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLCO4C1Q6ZQN7 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLCO4C1Q6ZQN7 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLCO4C1Q6ZQN7 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLCO4C1Q6ZQN7 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLCO4C1Q6ZQN7 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLCO4C1Q6ZQN7 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLCO4C1Q6ZQN7 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SLCO4C1Q6ZQN7 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLCO4C1Q6ZQN7 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SLCO4C1Q6ZQN7 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLCO4C1Q6ZQN7 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLCO4C1Q6ZQN7 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLCO4C1Q6ZQN7 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLCO4C1Q6ZQN7 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLCO4C1Q6ZQN7 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLCO4C1Q6ZQN7 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLCO4C1Q6ZQN7 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLCO4C1Q6ZQN7 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLCO4C1Q6ZQN7 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLCO4C1Q6ZQN7 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLCO4C1Q6ZQN7 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLCO4C1Q6ZQN7 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLCO4C1Q6ZQN7 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLCO4C1Q6ZQN7 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLCO4C1Q6ZQN7 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLCO4C1Q6ZQN7 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLCO4C1Q6ZQN7 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLCO4C1Q6ZQN7 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLCO4C1Q6ZQN7 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLCO4C1Q6ZQN7 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLCO4C1Q6ZQN7 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLCO4C1Q6ZQN7 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SLCO4C1Q6ZQN7 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLCO4C1Q6ZQN7 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLCO4C1Q6ZQN7 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLCO4C1Q6ZQN7 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLCO4C1Q6ZQN7 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLCO4C1Q6ZQN7 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLCO4C1Q6ZQN7 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLCO4C1Q6ZQN7 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms