Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW56

ATRAID, All-trans retinoic acid-induced differentiation factor, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRAIDQ6UW56 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ATRAIDQ6UW56 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ATRAIDQ6UW56 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ATRAIDQ6UW56 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ATRAIDQ6UW56 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ATRAIDQ6UW56 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATRAIDQ6UW56 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ATRAIDQ6UW56 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ATRAIDQ6UW56 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATRAIDQ6UW56 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATRAIDQ6UW56 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ATRAIDQ6UW56 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATRAIDQ6UW56 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATRAIDQ6UW56 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATRAIDQ6UW56 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ATRAIDQ6UW56 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ATRAIDQ6UW56 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATRAIDQ6UW56 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATRAIDQ6UW56 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ATRAIDQ6UW56 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ATRAIDQ6UW56 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ATRAIDQ6UW56 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATRAIDQ6UW56 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ATRAIDQ6UW56 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ATRAIDQ6UW56 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATRAIDQ6UW56 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATRAIDQ6UW56 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATRAIDQ6UW56 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATRAIDQ6UW56 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ATRAIDQ6UW56 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATRAIDQ6UW56 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATRAIDQ6UW56 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATRAIDQ6UW56 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATRAIDQ6UW56 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATRAIDQ6UW56 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATRAIDQ6UW56 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATRAIDQ6UW56 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ATRAIDQ6UW56 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATRAIDQ6UW56 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ATRAIDQ6UW56 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ATRAIDQ6UW56 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ATRAIDQ6UW56 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATRAIDQ6UW56 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATRAIDQ6UW56 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ATRAIDQ6UW56 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ATRAIDQ6UW56 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ATRAIDQ6UW56 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATRAIDQ6UW56 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATRAIDQ6UW56 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
ATRAIDQ6UW56 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ATRAIDQ6UW56 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
ATRAIDQ6UW56 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ATRAIDQ6UW56 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATRAIDQ6UW56 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ATRAIDQ6UW56 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATRAIDQ6UW56 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATRAIDQ6UW56 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATRAIDQ6UW56 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATRAIDQ6UW56 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
ATRAIDQ6UW56 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ATRAIDQ6UW56 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATRAIDQ6UW56 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
ATRAIDQ6UW56 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ATRAIDQ6UW56 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATRAIDQ6UW56 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ATRAIDQ6UW56 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ATRAIDQ6UW56 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ATRAIDQ6UW56 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATRAIDQ6UW56 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATRAIDQ6UW56 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATRAIDQ6UW56 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATRAIDQ6UW56 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATRAIDQ6UW56 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ATRAIDQ6UW56 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ATRAIDQ6UW56 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATRAIDQ6UW56 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ATRAIDQ6UW56 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ATRAIDQ6UW56 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATRAIDQ6UW56 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATRAIDQ6UW56 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
ATRAIDQ6UW56 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATRAIDQ6UW56 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATRAIDQ6UW56 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ATRAIDQ6UW56 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATRAIDQ6UW56 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATRAIDQ6UW56 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATRAIDQ6UW56 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ATRAIDQ6UW56 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ATRAIDQ6UW56 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ATRAIDQ6UW56 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATRAIDQ6UW56 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ATRAIDQ6UW56 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ATRAIDQ6UW56 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ATRAIDQ6UW56 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATRAIDQ6UW56 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ATRAIDQ6UW56 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ATRAIDQ6UW56 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ATRAIDQ6UW56 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATRAIDQ6UW56 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATRAIDQ6UW56 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms