Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LETMD1Q6P1Q0 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LETMD1Q6P1Q0 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LETMD1Q6P1Q0 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LETMD1Q6P1Q0 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LETMD1Q6P1Q0 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LETMD1Q6P1Q0 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
LETMD1Q6P1Q0 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LETMD1Q6P1Q0 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
LETMD1Q6P1Q0 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LETMD1Q6P1Q0 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LETMD1Q6P1Q0 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LETMD1Q6P1Q0 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LETMD1Q6P1Q0 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LETMD1Q6P1Q0 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LETMD1Q6P1Q0 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LETMD1Q6P1Q0 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LETMD1Q6P1Q0 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LETMD1Q6P1Q0 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LETMD1Q6P1Q0 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LETMD1Q6P1Q0 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LETMD1Q6P1Q0 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LETMD1Q6P1Q0 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LETMD1Q6P1Q0 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
LETMD1Q6P1Q0 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
LETMD1Q6P1Q0 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LETMD1Q6P1Q0 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LETMD1Q6P1Q0 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
LETMD1Q6P1Q0 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LETMD1Q6P1Q0 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LETMD1Q6P1Q0 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LETMD1Q6P1Q0 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LETMD1Q6P1Q0 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LETMD1Q6P1Q0 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
LETMD1Q6P1Q0 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LETMD1Q6P1Q0 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LETMD1Q6P1Q0 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LETMD1Q6P1Q0 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LETMD1Q6P1Q0 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LETMD1Q6P1Q0 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LETMD1Q6P1Q0 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LETMD1Q6P1Q0 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LETMD1Q6P1Q0 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
LETMD1Q6P1Q0 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms