Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ49

SDE2, Protein SDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDE2Q6IQ49 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SDE2Q6IQ49 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SDE2Q6IQ49 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SDE2Q6IQ49 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SDE2Q6IQ49 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SDE2Q6IQ49 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SDE2Q6IQ49 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SDE2Q6IQ49 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SDE2Q6IQ49 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SDE2Q6IQ49 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SDE2Q6IQ49 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SDE2Q6IQ49 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SDE2Q6IQ49 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SDE2Q6IQ49 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SDE2Q6IQ49 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SDE2Q6IQ49 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SDE2Q6IQ49 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SDE2Q6IQ49 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SDE2Q6IQ49 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SDE2Q6IQ49 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SDE2Q6IQ49 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SDE2Q6IQ49 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SDE2Q6IQ49 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SDE2Q6IQ49 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SDE2Q6IQ49 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SDE2Q6IQ49 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SDE2Q6IQ49 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SDE2Q6IQ49 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SDE2Q6IQ49 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SDE2Q6IQ49 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SDE2Q6IQ49 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SDE2Q6IQ49 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SDE2Q6IQ49 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SDE2Q6IQ49 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SDE2Q6IQ49 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SDE2Q6IQ49 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SDE2Q6IQ49 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SDE2Q6IQ49 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SDE2Q6IQ49 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SDE2Q6IQ49 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SDE2Q6IQ49 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SDE2Q6IQ49 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SDE2Q6IQ49 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SDE2Q6IQ49 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SDE2Q6IQ49 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SDE2Q6IQ49 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SDE2Q6IQ49 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SDE2Q6IQ49 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SDE2Q6IQ49 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SDE2Q6IQ49 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SDE2Q6IQ49 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SDE2Q6IQ49 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SDE2Q6IQ49 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SDE2Q6IQ49 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SDE2Q6IQ49 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SDE2Q6IQ49 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SDE2Q6IQ49 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SDE2Q6IQ49 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SDE2Q6IQ49 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SDE2Q6IQ49 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SDE2Q6IQ49 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SDE2Q6IQ49 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SDE2Q6IQ49 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SDE2Q6IQ49 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SDE2Q6IQ49 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SDE2Q6IQ49 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SDE2Q6IQ49 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SDE2Q6IQ49 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SDE2Q6IQ49 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SDE2Q6IQ49 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SDE2Q6IQ49 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SDE2Q6IQ49 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SDE2Q6IQ49 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SDE2Q6IQ49 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SDE2Q6IQ49 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SDE2Q6IQ49 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SDE2Q6IQ49 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SDE2Q6IQ49 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SDE2Q6IQ49 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SDE2Q6IQ49 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SDE2Q6IQ49 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SDE2Q6IQ49 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SDE2Q6IQ49 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SDE2Q6IQ49 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SDE2Q6IQ49 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SDE2Q6IQ49 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SDE2Q6IQ49 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SDE2Q6IQ49 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SDE2Q6IQ49 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SDE2Q6IQ49 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SDE2Q6IQ49 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SDE2Q6IQ49 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SDE2Q6IQ49 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SDE2Q6IQ49 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SDE2Q6IQ49 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SDE2Q6IQ49 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SDE2Q6IQ49 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SDE2Q6IQ49 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SDE2Q6IQ49 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SDE2Q6IQ49 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms