Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZ18

SHE, SH2 domain-containing adapter protein E, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHEQ5VZ18 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms