Protein–RNA interactions for Protein: Q5T6S3

PHF19, PHD finger protein 19, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF19Q5T6S3 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHF19Q5T6S3 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHF19Q5T6S3 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHF19Q5T6S3 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHF19Q5T6S3 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHF19Q5T6S3 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHF19Q5T6S3 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHF19Q5T6S3 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHF19Q5T6S3 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHF19Q5T6S3 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHF19Q5T6S3 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHF19Q5T6S3 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHF19Q5T6S3 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PHF19Q5T6S3 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PHF19Q5T6S3 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHF19Q5T6S3 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHF19Q5T6S3 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PHF19Q5T6S3 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHF19Q5T6S3 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHF19Q5T6S3 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHF19Q5T6S3 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHF19Q5T6S3 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHF19Q5T6S3 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHF19Q5T6S3 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHF19Q5T6S3 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHF19Q5T6S3 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHF19Q5T6S3 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHF19Q5T6S3 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHF19Q5T6S3 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHF19Q5T6S3 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHF19Q5T6S3 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHF19Q5T6S3 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHF19Q5T6S3 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHF19Q5T6S3 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHF19Q5T6S3 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHF19Q5T6S3 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHF19Q5T6S3 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHF19Q5T6S3 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PHF19Q5T6S3 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHF19Q5T6S3 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHF19Q5T6S3 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PHF19Q5T6S3 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHF19Q5T6S3 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHF19Q5T6S3 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHF19Q5T6S3 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHF19Q5T6S3 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHF19Q5T6S3 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHF19Q5T6S3 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PHF19Q5T6S3 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PHF19Q5T6S3 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PHF19Q5T6S3 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
PHF19Q5T6S3 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PHF19Q5T6S3 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PHF19Q5T6S3 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PHF19Q5T6S3 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PHF19Q5T6S3 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PHF19Q5T6S3 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PHF19Q5T6S3 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PHF19Q5T6S3 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PHF19Q5T6S3 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PHF19Q5T6S3 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PHF19Q5T6S3 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PHF19Q5T6S3 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PHF19Q5T6S3 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PHF19Q5T6S3 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PHF19Q5T6S3 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PHF19Q5T6S3 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PHF19Q5T6S3 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PHF19Q5T6S3 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PHF19Q5T6S3 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PHF19Q5T6S3 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PHF19Q5T6S3 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PHF19Q5T6S3 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PHF19Q5T6S3 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PHF19Q5T6S3 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PHF19Q5T6S3 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PHF19Q5T6S3 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PHF19Q5T6S3 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PHF19Q5T6S3 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PHF19Q5T6S3 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PHF19Q5T6S3 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PHF19Q5T6S3 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHF19Q5T6S3 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHF19Q5T6S3 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHF19Q5T6S3 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHF19Q5T6S3 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHF19Q5T6S3 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHF19Q5T6S3 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHF19Q5T6S3 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHF19Q5T6S3 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PHF19Q5T6S3 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHF19Q5T6S3 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PHF19Q5T6S3 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHF19Q5T6S3 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHF19Q5T6S3 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHF19Q5T6S3 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHF19Q5T6S3 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHF19Q5T6S3 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHF19Q5T6S3 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHF19Q5T6S3 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms