Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZQ8

CELF3, CUGBP Elav-like family member 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF3Q5SZQ8 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CELF3Q5SZQ8 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CELF3Q5SZQ8 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CELF3Q5SZQ8 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CELF3Q5SZQ8 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CELF3Q5SZQ8 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CELF3Q5SZQ8 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CELF3Q5SZQ8 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CELF3Q5SZQ8 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CELF3Q5SZQ8 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CELF3Q5SZQ8 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CELF3Q5SZQ8 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CELF3Q5SZQ8 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CELF3Q5SZQ8 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CELF3Q5SZQ8 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CELF3Q5SZQ8 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CELF3Q5SZQ8 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CELF3Q5SZQ8 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CELF3Q5SZQ8 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CELF3Q5SZQ8 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CELF3Q5SZQ8 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CELF3Q5SZQ8 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CELF3Q5SZQ8 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CELF3Q5SZQ8 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CELF3Q5SZQ8 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CELF3Q5SZQ8 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CELF3Q5SZQ8 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CELF3Q5SZQ8 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CELF3Q5SZQ8 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CELF3Q5SZQ8 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CELF3Q5SZQ8 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CELF3Q5SZQ8 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CELF3Q5SZQ8 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CELF3Q5SZQ8 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CELF3Q5SZQ8 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CELF3Q5SZQ8 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CELF3Q5SZQ8 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CELF3Q5SZQ8 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CELF3Q5SZQ8 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CELF3Q5SZQ8 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CELF3Q5SZQ8 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CELF3Q5SZQ8 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CELF3Q5SZQ8 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CELF3Q5SZQ8 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CELF3Q5SZQ8 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CELF3Q5SZQ8 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CELF3Q5SZQ8 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CELF3Q5SZQ8 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CELF3Q5SZQ8 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CELF3Q5SZQ8 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CELF3Q5SZQ8 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CELF3Q5SZQ8 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CELF3Q5SZQ8 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CELF3Q5SZQ8 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CELF3Q5SZQ8 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CELF3Q5SZQ8 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
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CELF3Q5SZQ8 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CELF3Q5SZQ8 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CELF3Q5SZQ8 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CELF3Q5SZQ8 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CELF3Q5SZQ8 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CELF3Q5SZQ8 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CELF3Q5SZQ8 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CELF3Q5SZQ8 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
CELF3Q5SZQ8 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CELF3Q5SZQ8 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CELF3Q5SZQ8 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CELF3Q5SZQ8 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CELF3Q5SZQ8 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CELF3Q5SZQ8 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CELF3Q5SZQ8 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CELF3Q5SZQ8 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CELF3Q5SZQ8 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CELF3Q5SZQ8 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CELF3Q5SZQ8 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CELF3Q5SZQ8 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CELF3Q5SZQ8 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
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CELF3Q5SZQ8 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CELF3Q5SZQ8 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CELF3Q5SZQ8 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CELF3Q5SZQ8 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CELF3Q5SZQ8 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
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CELF3Q5SZQ8 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CELF3Q5SZQ8 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CELF3Q5SZQ8 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CELF3Q5SZQ8 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CELF3Q5SZQ8 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CELF3Q5SZQ8 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CELF3Q5SZQ8 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CELF3Q5SZQ8 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CELF3Q5SZQ8 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CELF3Q5SZQ8 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CELF3Q5SZQ8 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CELF3Q5SZQ8 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CELF3Q5SZQ8 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CELF3Q5SZQ8 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
CELF3Q5SZQ8 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
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