Protein–RNA interactions for Protein: Q5JTW2

CEP78, Centrosomal protein of 78 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP78Q5JTW2 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CEP78Q5JTW2 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CEP78Q5JTW2 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CEP78Q5JTW2 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CEP78Q5JTW2 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CEP78Q5JTW2 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CEP78Q5JTW2 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CEP78Q5JTW2 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CEP78Q5JTW2 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CEP78Q5JTW2 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CEP78Q5JTW2 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CEP78Q5JTW2 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CEP78Q5JTW2 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CEP78Q5JTW2 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CEP78Q5JTW2 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CEP78Q5JTW2 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CEP78Q5JTW2 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CEP78Q5JTW2 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CEP78Q5JTW2 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CEP78Q5JTW2 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CEP78Q5JTW2 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CEP78Q5JTW2 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CEP78Q5JTW2 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CEP78Q5JTW2 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CEP78Q5JTW2 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CEP78Q5JTW2 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CEP78Q5JTW2 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CEP78Q5JTW2 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CEP78Q5JTW2 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CEP78Q5JTW2 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CEP78Q5JTW2 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CEP78Q5JTW2 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CEP78Q5JTW2 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CEP78Q5JTW2 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CEP78Q5JTW2 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CEP78Q5JTW2 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CEP78Q5JTW2 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CEP78Q5JTW2 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CEP78Q5JTW2 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CEP78Q5JTW2 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CEP78Q5JTW2 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CEP78Q5JTW2 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CEP78Q5JTW2 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CEP78Q5JTW2 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CEP78Q5JTW2 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CEP78Q5JTW2 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CEP78Q5JTW2 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CEP78Q5JTW2 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CEP78Q5JTW2 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CEP78Q5JTW2 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CEP78Q5JTW2 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CEP78Q5JTW2 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CEP78Q5JTW2 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CEP78Q5JTW2 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CEP78Q5JTW2 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CEP78Q5JTW2 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CEP78Q5JTW2 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CEP78Q5JTW2 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CEP78Q5JTW2 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CEP78Q5JTW2 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CEP78Q5JTW2 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CEP78Q5JTW2 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CEP78Q5JTW2 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CEP78Q5JTW2 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CEP78Q5JTW2 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CEP78Q5JTW2 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CEP78Q5JTW2 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CEP78Q5JTW2 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CEP78Q5JTW2 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CEP78Q5JTW2 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CEP78Q5JTW2 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CEP78Q5JTW2 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CEP78Q5JTW2 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CEP78Q5JTW2 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CEP78Q5JTW2 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CEP78Q5JTW2 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CEP78Q5JTW2 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CEP78Q5JTW2 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CEP78Q5JTW2 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CEP78Q5JTW2 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CEP78Q5JTW2 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CEP78Q5JTW2 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CEP78Q5JTW2 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CEP78Q5JTW2 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CEP78Q5JTW2 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CEP78Q5JTW2 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CEP78Q5JTW2 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CEP78Q5JTW2 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CEP78Q5JTW2 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CEP78Q5JTW2 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CEP78Q5JTW2 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CEP78Q5JTW2 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CEP78Q5JTW2 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CEP78Q5JTW2 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CEP78Q5JTW2 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CEP78Q5JTW2 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CEP78Q5JTW2 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CEP78Q5JTW2 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CEP78Q5JTW2 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CEP78Q5JTW2 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms