Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTXN3Q4LDR2 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTXN3Q4LDR2 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTXN3Q4LDR2 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTXN3Q4LDR2 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTXN3Q4LDR2 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CTXN3Q4LDR2 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTXN3Q4LDR2 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTXN3Q4LDR2 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CTXN3Q4LDR2 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTXN3Q4LDR2 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CTXN3Q4LDR2 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTXN3Q4LDR2 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTXN3Q4LDR2 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTXN3Q4LDR2 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTXN3Q4LDR2 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTXN3Q4LDR2 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CTXN3Q4LDR2 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTXN3Q4LDR2 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTXN3Q4LDR2 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CTXN3Q4LDR2 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CTXN3Q4LDR2 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTXN3Q4LDR2 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CTXN3Q4LDR2 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTXN3Q4LDR2 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTXN3Q4LDR2 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTXN3Q4LDR2 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTXN3Q4LDR2 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CTXN3Q4LDR2 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CTXN3Q4LDR2 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTXN3Q4LDR2 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTXN3Q4LDR2 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CTXN3Q4LDR2 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTXN3Q4LDR2 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTXN3Q4LDR2 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTXN3Q4LDR2 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTXN3Q4LDR2 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTXN3Q4LDR2 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTXN3Q4LDR2 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTXN3Q4LDR2 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTXN3Q4LDR2 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CTXN3Q4LDR2 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTXN3Q4LDR2 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTXN3Q4LDR2 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTXN3Q4LDR2 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTXN3Q4LDR2 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTXN3Q4LDR2 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTXN3Q4LDR2 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
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CTXN3Q4LDR2 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTXN3Q4LDR2 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CTXN3Q4LDR2 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTXN3Q4LDR2 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTXN3Q4LDR2 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
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CTXN3Q4LDR2 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CTXN3Q4LDR2 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTXN3Q4LDR2 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTXN3Q4LDR2 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTXN3Q4LDR2 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTXN3Q4LDR2 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTXN3Q4LDR2 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTXN3Q4LDR2 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTXN3Q4LDR2 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTXN3Q4LDR2 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTXN3Q4LDR2 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTXN3Q4LDR2 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTXN3Q4LDR2 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTXN3Q4LDR2 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTXN3Q4LDR2 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTXN3Q4LDR2 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTXN3Q4LDR2 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTXN3Q4LDR2 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTXN3Q4LDR2 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTXN3Q4LDR2 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CTXN3Q4LDR2 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTXN3Q4LDR2 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTXN3Q4LDR2 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTXN3Q4LDR2 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTXN3Q4LDR2 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTXN3Q4LDR2 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTXN3Q4LDR2 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTXN3Q4LDR2 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTXN3Q4LDR2 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTXN3Q4LDR2 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
CTXN3Q4LDR2 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTXN3Q4LDR2 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTXN3Q4LDR2 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTXN3Q4LDR2 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTXN3Q4LDR2 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTXN3Q4LDR2 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTXN3Q4LDR2 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CTXN3Q4LDR2 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTXN3Q4LDR2 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTXN3Q4LDR2 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTXN3Q4LDR2 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTXN3Q4LDR2 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTXN3Q4LDR2 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTXN3Q4LDR2 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
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