Protein–RNA interactions for Protein: Q495C1

RNF212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF212Q495C1 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RNF212Q495C1 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RNF212Q495C1 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RNF212Q495C1 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RNF212Q495C1 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RNF212Q495C1 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RNF212Q495C1 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RNF212Q495C1 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RNF212Q495C1 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RNF212Q495C1 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RNF212Q495C1 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RNF212Q495C1 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RNF212Q495C1 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RNF212Q495C1 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RNF212Q495C1 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RNF212Q495C1 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RNF212Q495C1 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RNF212Q495C1 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RNF212Q495C1 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
RNF212Q495C1 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RNF212Q495C1 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RNF212Q495C1 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RNF212Q495C1 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RNF212Q495C1 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RNF212Q495C1 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RNF212Q495C1 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RNF212Q495C1 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RNF212Q495C1 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RNF212Q495C1 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RNF212Q495C1 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RNF212Q495C1 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RNF212Q495C1 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RNF212Q495C1 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RNF212Q495C1 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RNF212Q495C1 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RNF212Q495C1 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RNF212Q495C1 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RNF212Q495C1 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RNF212Q495C1 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RNF212Q495C1 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RNF212Q495C1 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RNF212Q495C1 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RNF212Q495C1 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RNF212Q495C1 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RNF212Q495C1 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RNF212Q495C1 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RNF212Q495C1 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RNF212Q495C1 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RNF212Q495C1 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RNF212Q495C1 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RNF212Q495C1 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RNF212Q495C1 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RNF212Q495C1 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RNF212Q495C1 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RNF212Q495C1 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
RNF212Q495C1 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RNF212Q495C1 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
RNF212Q495C1 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RNF212Q495C1 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RNF212Q495C1 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RNF212Q495C1 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
RNF212Q495C1 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RNF212Q495C1 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RNF212Q495C1 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RNF212Q495C1 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RNF212Q495C1 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RNF212Q495C1 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RNF212Q495C1 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RNF212Q495C1 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RNF212Q495C1 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RNF212Q495C1 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RNF212Q495C1 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.05■□□□□ 0
RNF212Q495C1 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RNF212Q495C1 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RNF212Q495C1 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
RNF212Q495C1 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
RNF212Q495C1 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RNF212Q495C1 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RNF212Q495C1 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RNF212Q495C1 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RNF212Q495C1 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
RNF212Q495C1 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RNF212Q495C1 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RNF212Q495C1 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
RNF212Q495C1 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RNF212Q495C1 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RNF212Q495C1 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RNF212Q495C1 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RNF212Q495C1 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RNF212Q495C1 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RNF212Q495C1 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RNF212Q495C1 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RNF212Q495C1 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
RNF212Q495C1 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RNF212Q495C1 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RNF212Q495C1 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RNF212Q495C1 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RNF212Q495C1 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RNF212Q495C1 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RNF212Q495C1 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms