Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

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Length 555 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC96Q2M329 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC96Q2M329 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC96Q2M329 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC96Q2M329 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC96Q2M329 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC96Q2M329 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC96Q2M329 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC96Q2M329 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC96Q2M329 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC96Q2M329 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC96Q2M329 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC96Q2M329 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC96Q2M329 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC96Q2M329 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC96Q2M329 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC96Q2M329 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC96Q2M329 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC96Q2M329 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC96Q2M329 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC96Q2M329 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC96Q2M329 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC96Q2M329 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC96Q2M329 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC96Q2M329 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC96Q2M329 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC96Q2M329 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC96Q2M329 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC96Q2M329 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC96Q2M329 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC96Q2M329 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC96Q2M329 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC96Q2M329 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC96Q2M329 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC96Q2M329 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC96Q2M329 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC96Q2M329 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC96Q2M329 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC96Q2M329 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC96Q2M329 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC96Q2M329 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC96Q2M329 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC96Q2M329 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC96Q2M329 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC96Q2M329 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC96Q2M329 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC96Q2M329 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC96Q2M329 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC96Q2M329 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC96Q2M329 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC96Q2M329 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC96Q2M329 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC96Q2M329 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC96Q2M329 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC96Q2M329 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC96Q2M329 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
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CCDC96Q2M329 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC96Q2M329 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
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CCDC96Q2M329 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC96Q2M329 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC96Q2M329 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC96Q2M329 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC96Q2M329 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC96Q2M329 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC96Q2M329 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC96Q2M329 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC96Q2M329 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC96Q2M329 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC96Q2M329 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC96Q2M329 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC96Q2M329 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC96Q2M329 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC96Q2M329 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC96Q2M329 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC96Q2M329 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC96Q2M329 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC96Q2M329 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC96Q2M329 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC96Q2M329 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC96Q2M329 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC96Q2M329 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC96Q2M329 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC96Q2M329 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC96Q2M329 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC96Q2M329 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC96Q2M329 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC96Q2M329 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC96Q2M329 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC96Q2M329 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC96Q2M329 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC96Q2M329 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC96Q2M329 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC96Q2M329 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC96Q2M329 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC96Q2M329 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC96Q2M329 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC96Q2M329 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC96Q2M329 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
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