Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC27Q2M243 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC27Q2M243 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC27Q2M243 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC27Q2M243 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC27Q2M243 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC27Q2M243 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC27Q2M243 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC27Q2M243 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC27Q2M243 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC27Q2M243 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC27Q2M243 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC27Q2M243 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC27Q2M243 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC27Q2M243 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC27Q2M243 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC27Q2M243 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC27Q2M243 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC27Q2M243 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC27Q2M243 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC27Q2M243 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC27Q2M243 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC27Q2M243 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC27Q2M243 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC27Q2M243 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC27Q2M243 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC27Q2M243 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC27Q2M243 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC27Q2M243 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC27Q2M243 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC27Q2M243 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC27Q2M243 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC27Q2M243 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC27Q2M243 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC27Q2M243 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC27Q2M243 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC27Q2M243 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC27Q2M243 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC27Q2M243 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC27Q2M243 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC27Q2M243 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC27Q2M243 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC27Q2M243 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC27Q2M243 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC27Q2M243 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC27Q2M243 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC27Q2M243 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC27Q2M243 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC27Q2M243 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC27Q2M243 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC27Q2M243 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC27Q2M243 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC27Q2M243 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC27Q2M243 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC27Q2M243 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC27Q2M243 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC27Q2M243 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC27Q2M243 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC27Q2M243 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC27Q2M243 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC27Q2M243 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC27Q2M243 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC27Q2M243 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC27Q2M243 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC27Q2M243 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC27Q2M243 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC27Q2M243 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC27Q2M243 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC27Q2M243 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC27Q2M243 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC27Q2M243 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC27Q2M243 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC27Q2M243 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC27Q2M243 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC27Q2M243 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC27Q2M243 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC27Q2M243 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC27Q2M243 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC27Q2M243 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC27Q2M243 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC27Q2M243 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC27Q2M243 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC27Q2M243 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC27Q2M243 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC27Q2M243 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC27Q2M243 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC27Q2M243 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC27Q2M243 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC27Q2M243 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC27Q2M243 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC27Q2M243 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC27Q2M243 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC27Q2M243 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC27Q2M243 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC27Q2M243 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC27Q2M243 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC27Q2M243 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC27Q2M243 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC27Q2M243 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC27Q2M243 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms