Protein–RNA interactions for Protein: Q2M1V0

ISX, Intestine-specific homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISXQ2M1V0 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ISXQ2M1V0 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ISXQ2M1V0 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ISXQ2M1V0 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ISXQ2M1V0 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ISXQ2M1V0 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ISXQ2M1V0 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ISXQ2M1V0 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
ISXQ2M1V0 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ISXQ2M1V0 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ISXQ2M1V0 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ISXQ2M1V0 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ISXQ2M1V0 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ISXQ2M1V0 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms