Protein–RNA interactions for Protein: Q16822

PCK2, Phosphoenolpyruvate carboxykinase [GTP], mitochondrial, humanhuman

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Length 640 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK2Q16822 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCK2Q16822 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCK2Q16822 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PCK2Q16822 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCK2Q16822 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCK2Q16822 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCK2Q16822 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCK2Q16822 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCK2Q16822 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCK2Q16822 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCK2Q16822 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCK2Q16822 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCK2Q16822 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCK2Q16822 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PCK2Q16822 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCK2Q16822 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCK2Q16822 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCK2Q16822 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PCK2Q16822 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCK2Q16822 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCK2Q16822 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCK2Q16822 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCK2Q16822 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCK2Q16822 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCK2Q16822 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCK2Q16822 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCK2Q16822 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PCK2Q16822 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCK2Q16822 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCK2Q16822 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCK2Q16822 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCK2Q16822 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PCK2Q16822 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCK2Q16822 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCK2Q16822 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCK2Q16822 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCK2Q16822 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCK2Q16822 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCK2Q16822 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCK2Q16822 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCK2Q16822 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PCK2Q16822 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCK2Q16822 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCK2Q16822 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCK2Q16822 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCK2Q16822 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCK2Q16822 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCK2Q16822 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCK2Q16822 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCK2Q16822 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCK2Q16822 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCK2Q16822 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCK2Q16822 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCK2Q16822 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCK2Q16822 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCK2Q16822 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PCK2Q16822 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCK2Q16822 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCK2Q16822 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCK2Q16822 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCK2Q16822 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCK2Q16822 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCK2Q16822 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCK2Q16822 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCK2Q16822 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PCK2Q16822 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCK2Q16822 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCK2Q16822 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCK2Q16822 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCK2Q16822 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCK2Q16822 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCK2Q16822 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCK2Q16822 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCK2Q16822 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCK2Q16822 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCK2Q16822 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCK2Q16822 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCK2Q16822 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
PCK2Q16822 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.26
PCK2Q16822 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
PCK2Q16822 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
PCK2Q16822 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
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