Protein–RNA interactions for Protein: Q16798

ME3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME3Q16798 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ME3Q16798 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ME3Q16798 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ME3Q16798 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ME3Q16798 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ME3Q16798 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ME3Q16798 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ME3Q16798 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ME3Q16798 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ME3Q16798 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ME3Q16798 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ME3Q16798 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ME3Q16798 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ME3Q16798 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ME3Q16798 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ME3Q16798 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ME3Q16798 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ME3Q16798 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ME3Q16798 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ME3Q16798 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ME3Q16798 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ME3Q16798 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ME3Q16798 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ME3Q16798 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ME3Q16798 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
ME3Q16798 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ME3Q16798 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ME3Q16798 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ME3Q16798 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ME3Q16798 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ME3Q16798 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ME3Q16798 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ME3Q16798 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ME3Q16798 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ME3Q16798 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ME3Q16798 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ME3Q16798 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ME3Q16798 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ME3Q16798 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ME3Q16798 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ME3Q16798 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ME3Q16798 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ME3Q16798 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ME3Q16798 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ME3Q16798 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ME3Q16798 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ME3Q16798 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ME3Q16798 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ME3Q16798 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ME3Q16798 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ME3Q16798 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ME3Q16798 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ME3Q16798 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ME3Q16798 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ME3Q16798 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ME3Q16798 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ME3Q16798 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ME3Q16798 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ME3Q16798 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ME3Q16798 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ME3Q16798 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ME3Q16798 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ME3Q16798 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ME3Q16798 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ME3Q16798 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ME3Q16798 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ME3Q16798 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ME3Q16798 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ME3Q16798 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ME3Q16798 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ME3Q16798 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ME3Q16798 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ME3Q16798 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ME3Q16798 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ME3Q16798 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ME3Q16798 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ME3Q16798 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ME3Q16798 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ME3Q16798 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ME3Q16798 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ME3Q16798 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ME3Q16798 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ME3Q16798 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ME3Q16798 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ME3Q16798 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ME3Q16798 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ME3Q16798 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ME3Q16798 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ME3Q16798 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ME3Q16798 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ME3Q16798 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ME3Q16798 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ME3Q16798 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ME3Q16798 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ME3Q16798 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ME3Q16798 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ME3Q16798 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ME3Q16798 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ME3Q16798 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ME3Q16798 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
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