Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
FOXD1Q16676 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
FOXD1Q16676 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
FOXD1Q16676 OR5B12-201ENST00000302572 1054 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
FOXD1Q16676 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
FOXD1Q16676 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
FOXD1Q16676 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
FOXD1Q16676 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
FOXD1Q16676 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
FOXD1Q16676 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
FOXD1Q16676 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
FOXD1Q16676 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
FOXD1Q16676 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
FOXD1Q16676 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
FOXD1Q16676 TMEM154-204ENST00000613578 486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
FOXD1Q16676 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
FOXD1Q16676 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
FOXD1Q16676 AC138907.10-201ENST00000623708 983 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
FOXD1Q16676 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
FOXD1Q16676 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
FOXD1Q16676 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
FOXD1Q16676 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
FOXD1Q16676 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
FOXD1Q16676 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
FOXD1Q16676 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
FOXD1Q16676 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
FOXD1Q16676 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
FOXD1Q16676 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
FOXD1Q16676 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
FOXD1Q16676 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
FOXD1Q16676 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
FOXD1Q16676 COA1-202ENST00000310564 1085 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
FOXD1Q16676 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
FOXD1Q16676 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
FOXD1Q16676 AP001830.1-201ENST00000528717 692 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
FOXD1Q16676 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
FOXD1Q16676 AC104365.3-201ENST00000587011 625 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
FOXD1Q16676 AC009039.2-201ENST00000624524 529 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
FOXD1Q16676 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
FOXD1Q16676 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
FOXD1Q16676 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
FOXD1Q16676 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
FOXD1Q16676 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
FOXD1Q16676 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
FOXD1Q16676 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
FOXD1Q16676 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
FOXD1Q16676 AC073359.2-201ENST00000478814 351 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
FOXD1Q16676 RWDD4P1-201ENST00000488019 565 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
FOXD1Q16676 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
FOXD1Q16676 MTND4LP31-201ENST00000514859 294 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
FOXD1Q16676 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
FOXD1Q16676 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
FOXD1Q16676 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
FOXD1Q16676 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
FOXD1Q16676 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
FOXD1Q16676 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
FOXD1Q16676 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
FOXD1Q16676 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
FOXD1Q16676 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
FOXD1Q16676 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
FOXD1Q16676 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
FOXD1Q16676 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
FOXD1Q16676 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
FOXD1Q16676 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
FOXD1Q16676 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
FOXD1Q16676 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
FOXD1Q16676 AC017076.1-201ENST00000607613 578 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
FOXD1Q16676 AC097655.1-201ENST00000635075 318 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
FOXD1Q16676 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
FOXD1Q16676 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
FOXD1Q16676 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
FOXD1Q16676 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
FOXD1Q16676 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
FOXD1Q16676 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
FOXD1Q16676 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
FOXD1Q16676 GTPBP8-204ENST00000467752 686 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
FOXD1Q16676 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
FOXD1Q16676 LINC02429-202ENST00000513836 694 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
FOXD1Q16676 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
FOXD1Q16676 AC024933.1-201ENST00000608472 348 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
FOXD1Q16676 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
FOXD1Q16676 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
FOXD1Q16676 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
FOXD1Q16676 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
FOXD1Q16676 AL117378.2-201ENST00000622916 1337 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
FOXD1Q16676 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
FOXD1Q16676 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
FOXD1Q16676 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
FOXD1Q16676 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
FOXD1Q16676 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
FOXD1Q16676 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
FOXD1Q16676 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
FOXD1Q16676 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
FOXD1Q16676 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
FOXD1Q16676 AC013410.2-201ENST00000422627 201 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
FOXD1Q16676 AC099063.1-201ENST00000437128 324 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
FOXD1Q16676 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
FOXD1Q16676 MTND1P8-201ENST00000571424 950 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
FOXD1Q16676 AC005828.3-201ENST00000583552 591 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
FOXD1Q16676 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms