Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms