Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC6Q16204 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC6Q16204 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC6Q16204 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC6Q16204 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC6Q16204 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC6Q16204 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC6Q16204 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC6Q16204 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC6Q16204 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC6Q16204 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC6Q16204 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC6Q16204 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC6Q16204 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC6Q16204 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC6Q16204 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC6Q16204 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC6Q16204 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC6Q16204 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC6Q16204 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC6Q16204 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC6Q16204 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC6Q16204 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC6Q16204 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC6Q16204 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC6Q16204 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC6Q16204 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC6Q16204 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC6Q16204 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC6Q16204 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC6Q16204 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC6Q16204 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC6Q16204 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC6Q16204 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC6Q16204 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC6Q16204 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC6Q16204 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC6Q16204 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC6Q16204 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC6Q16204 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC6Q16204 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC6Q16204 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC6Q16204 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC6Q16204 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC6Q16204 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC6Q16204 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC6Q16204 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC6Q16204 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC6Q16204 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC6Q16204 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC6Q16204 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC6Q16204 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC6Q16204 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC6Q16204 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC6Q16204 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC6Q16204 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC6Q16204 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC6Q16204 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC6Q16204 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC6Q16204 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC6Q16204 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC6Q16204 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC6Q16204 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC6Q16204 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC6Q16204 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC6Q16204 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC6Q16204 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC6Q16204 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC6Q16204 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC6Q16204 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC6Q16204 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC6Q16204 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC6Q16204 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC6Q16204 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC6Q16204 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC6Q16204 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC6Q16204 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC6Q16204 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC6Q16204 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC6Q16204 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC6Q16204 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC6Q16204 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC6Q16204 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC6Q16204 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC6Q16204 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC6Q16204 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC6Q16204 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC6Q16204 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC6Q16204 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC6Q16204 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC6Q16204 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC6Q16204 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC6Q16204 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC6Q16204 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC6Q16204 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC6Q16204 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC6Q16204 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC6Q16204 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC6Q16204 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC6Q16204 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
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