Protein–RNA interactions for Protein: Q15650

TRIP4, Activating signal cointegrator 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP4Q15650 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRIP4Q15650 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRIP4Q15650 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRIP4Q15650 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRIP4Q15650 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRIP4Q15650 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRIP4Q15650 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRIP4Q15650 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRIP4Q15650 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
TRIP4Q15650 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRIP4Q15650 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRIP4Q15650 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRIP4Q15650 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRIP4Q15650 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
TRIP4Q15650 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRIP4Q15650 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRIP4Q15650 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRIP4Q15650 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRIP4Q15650 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRIP4Q15650 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRIP4Q15650 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRIP4Q15650 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIP4Q15650 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIP4Q15650 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIP4Q15650 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIP4Q15650 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIP4Q15650 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIP4Q15650 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIP4Q15650 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIP4Q15650 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIP4Q15650 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIP4Q15650 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIP4Q15650 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIP4Q15650 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIP4Q15650 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIP4Q15650 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIP4Q15650 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIP4Q15650 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIP4Q15650 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIP4Q15650 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIP4Q15650 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIP4Q15650 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIP4Q15650 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIP4Q15650 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIP4Q15650 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIP4Q15650 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIP4Q15650 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIP4Q15650 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIP4Q15650 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIP4Q15650 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIP4Q15650 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIP4Q15650 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIP4Q15650 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIP4Q15650 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIP4Q15650 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIP4Q15650 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIP4Q15650 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIP4Q15650 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIP4Q15650 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIP4Q15650 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIP4Q15650 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIP4Q15650 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIP4Q15650 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIP4Q15650 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIP4Q15650 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIP4Q15650 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIP4Q15650 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIP4Q15650 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIP4Q15650 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIP4Q15650 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIP4Q15650 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIP4Q15650 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIP4Q15650 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIP4Q15650 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIP4Q15650 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIP4Q15650 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIP4Q15650 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIP4Q15650 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIP4Q15650 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIP4Q15650 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIP4Q15650 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIP4Q15650 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIP4Q15650 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIP4Q15650 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIP4Q15650 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIP4Q15650 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIP4Q15650 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIP4Q15650 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIP4Q15650 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRIP4Q15650 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRIP4Q15650 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
TRIP4Q15650 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRIP4Q15650 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRIP4Q15650 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRIP4Q15650 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
TRIP4Q15650 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRIP4Q15650 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRIP4Q15650 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRIP4Q15650 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRIP4Q15650 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms