Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
RYR3Q15413 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
RYR3Q15413 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
RYR3Q15413 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
RYR3Q15413 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
RYR3Q15413 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
RYR3Q15413 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
RYR3Q15413 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
RYR3Q15413 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
RYR3Q15413 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
RYR3Q15413 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
RYR3Q15413 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
RYR3Q15413 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
RYR3Q15413 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
RYR3Q15413 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
RYR3Q15413 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
RYR3Q15413 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
RYR3Q15413 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
RYR3Q15413 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
RYR3Q15413 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
RYR3Q15413 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
RYR3Q15413 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RYR3Q15413 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
RYR3Q15413 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
RYR3Q15413 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RYR3Q15413 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
RYR3Q15413 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
RYR3Q15413 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RYR3Q15413 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
RYR3Q15413 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RYR3Q15413 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RYR3Q15413 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
RYR3Q15413 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
RYR3Q15413 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC12.65□□□□□ -0.38
RYR3Q15413 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
RYR3Q15413 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
RYR3Q15413 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RYR3Q15413 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
RYR3Q15413 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
RYR3Q15413 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RYR3Q15413 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
RYR3Q15413 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RYR3Q15413 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RYR3Q15413 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
RYR3Q15413 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
RYR3Q15413 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.39
RYR3Q15413 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.39
RYR3Q15413 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.39
RYR3Q15413 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.39
RYR3Q15413 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.39
RYR3Q15413 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
RYR3Q15413 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
RYR3Q15413 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
RYR3Q15413 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
RYR3Q15413 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
RYR3Q15413 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
RYR3Q15413 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
RYR3Q15413 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
RYR3Q15413 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
RYR3Q15413 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
RYR3Q15413 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
RYR3Q15413 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
RYR3Q15413 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
RYR3Q15413 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
RYR3Q15413 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
RYR3Q15413 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
RYR3Q15413 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
RYR3Q15413 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
RYR3Q15413 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
RYR3Q15413 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
RYR3Q15413 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
RYR3Q15413 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
RYR3Q15413 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
RYR3Q15413 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
RYR3Q15413 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
RYR3Q15413 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
RYR3Q15413 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
RYR3Q15413 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
RYR3Q15413 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
RYR3Q15413 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
RYR3Q15413 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
RYR3Q15413 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
RYR3Q15413 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
RYR3Q15413 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
RYR3Q15413 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
RYR3Q15413 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
RYR3Q15413 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
RYR3Q15413 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
RYR3Q15413 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
RYR3Q15413 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
RYR3Q15413 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
RYR3Q15413 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
RYR3Q15413 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
RYR3Q15413 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RYR3Q15413 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
RYR3Q15413 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RYR3Q15413 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC12.63□□□□□ -0.39
RYR3Q15413 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RYR3Q15413 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
RYR3Q15413 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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