Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMC1AQ14683 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMC1AQ14683 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SMC1AQ14683 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SMC1AQ14683 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SMC1AQ14683 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SMC1AQ14683 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SMC1AQ14683 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SMC1AQ14683 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SMC1AQ14683 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SMC1AQ14683 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SMC1AQ14683 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SMC1AQ14683 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SMC1AQ14683 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SMC1AQ14683 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SMC1AQ14683 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SMC1AQ14683 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SMC1AQ14683 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SMC1AQ14683 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SMC1AQ14683 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SMC1AQ14683 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SMC1AQ14683 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
SMC1AQ14683 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMC1AQ14683 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMC1AQ14683 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMC1AQ14683 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMC1AQ14683 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMC1AQ14683 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMC1AQ14683 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMC1AQ14683 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMC1AQ14683 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMC1AQ14683 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMC1AQ14683 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SMC1AQ14683 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMC1AQ14683 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SMC1AQ14683 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SMC1AQ14683 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SMC1AQ14683 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMC1AQ14683 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMC1AQ14683 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMC1AQ14683 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMC1AQ14683 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMC1AQ14683 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMC1AQ14683 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMC1AQ14683 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMC1AQ14683 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMC1AQ14683 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMC1AQ14683 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SMC1AQ14683 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SMC1AQ14683 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SMC1AQ14683 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SMC1AQ14683 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SMC1AQ14683 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SMC1AQ14683 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SMC1AQ14683 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SMC1AQ14683 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SMC1AQ14683 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SMC1AQ14683 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SMC1AQ14683 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SMC1AQ14683 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SMC1AQ14683 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SMC1AQ14683 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SMC1AQ14683 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SMC1AQ14683 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SMC1AQ14683 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SMC1AQ14683 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SMC1AQ14683 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SMC1AQ14683 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMC1AQ14683 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMC1AQ14683 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMC1AQ14683 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMC1AQ14683 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMC1AQ14683 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMC1AQ14683 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMC1AQ14683 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMC1AQ14683 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMC1AQ14683 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMC1AQ14683 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
SMC1AQ14683 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
SMC1AQ14683 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
SMC1AQ14683 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMC1AQ14683 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMC1AQ14683 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMC1AQ14683 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMC1AQ14683 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMC1AQ14683 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMC1AQ14683 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMC1AQ14683 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMC1AQ14683 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMC1AQ14683 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMC1AQ14683 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMC1AQ14683 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMC1AQ14683 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMC1AQ14683 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMC1AQ14683 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMC1AQ14683 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMC1AQ14683 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMC1AQ14683 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMC1AQ14683 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
SMC1AQ14683 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
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