Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
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GBX1Q14549 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
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GBX1Q14549 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GBX1Q14549 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
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GBX1Q14549 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GBX1Q14549 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GBX1Q14549 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GBX1Q14549 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GBX1Q14549 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GBX1Q14549 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
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GBX1Q14549 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GBX1Q14549 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GBX1Q14549 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GBX1Q14549 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GBX1Q14549 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GBX1Q14549 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GBX1Q14549 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GBX1Q14549 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GBX1Q14549 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GBX1Q14549 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GBX1Q14549 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
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