Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
COL9A2Q14055 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
COL9A2Q14055 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COL9A2Q14055 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COL9A2Q14055 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
COL9A2Q14055 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
COL9A2Q14055 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COL9A2Q14055 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COL9A2Q14055 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COL9A2Q14055 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COL9A2Q14055 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COL9A2Q14055 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COL9A2Q14055 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
COL9A2Q14055 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
COL9A2Q14055 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
COL9A2Q14055 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
COL9A2Q14055 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
COL9A2Q14055 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
COL9A2Q14055 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
COL9A2Q14055 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
COL9A2Q14055 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
COL9A2Q14055 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
COL9A2Q14055 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
COL9A2Q14055 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
COL9A2Q14055 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
COL9A2Q14055 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
COL9A2Q14055 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
COL9A2Q14055 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
COL9A2Q14055 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
COL9A2Q14055 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
COL9A2Q14055 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
COL9A2Q14055 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
COL9A2Q14055 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
COL9A2Q14055 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
COL9A2Q14055 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
COL9A2Q14055 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
COL9A2Q14055 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
COL9A2Q14055 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
COL9A2Q14055 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
COL9A2Q14055 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
COL9A2Q14055 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
COL9A2Q14055 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
COL9A2Q14055 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
COL9A2Q14055 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
COL9A2Q14055 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
COL9A2Q14055 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
COL9A2Q14055 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
COL9A2Q14055 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
COL9A2Q14055 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
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COL9A2Q14055 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
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COL9A2Q14055 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
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COL9A2Q14055 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
COL9A2Q14055 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
COL9A2Q14055 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
COL9A2Q14055 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
COL9A2Q14055 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
COL9A2Q14055 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
COL9A2Q14055 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
COL9A2Q14055 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
COL9A2Q14055 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
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COL9A2Q14055 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
COL9A2Q14055 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
COL9A2Q14055 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
COL9A2Q14055 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
COL9A2Q14055 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
COL9A2Q14055 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COL9A2Q14055 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
COL9A2Q14055 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
COL9A2Q14055 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
COL9A2Q14055 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COL9A2Q14055 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COL9A2Q14055 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COL9A2Q14055 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COL9A2Q14055 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COL9A2Q14055 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
COL9A2Q14055 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
COL9A2Q14055 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COL9A2Q14055 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COL9A2Q14055 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COL9A2Q14055 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COL9A2Q14055 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
COL9A2Q14055 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
COL9A2Q14055 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
COL9A2Q14055 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
COL9A2Q14055 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
COL9A2Q14055 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
COL9A2Q14055 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COL9A2Q14055 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
COL9A2Q14055 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
COL9A2Q14055 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
COL9A2Q14055 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
COL9A2Q14055 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
COL9A2Q14055 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
COL9A2Q14055 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
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