Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TCIRG1Q13488 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TCIRG1Q13488 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TCIRG1Q13488 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TCIRG1Q13488 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TCIRG1Q13488 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TCIRG1Q13488 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TCIRG1Q13488 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TCIRG1Q13488 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TCIRG1Q13488 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TCIRG1Q13488 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TCIRG1Q13488 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TCIRG1Q13488 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TCIRG1Q13488 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TCIRG1Q13488 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TCIRG1Q13488 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TCIRG1Q13488 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TCIRG1Q13488 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TCIRG1Q13488 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TCIRG1Q13488 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TCIRG1Q13488 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TCIRG1Q13488 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TCIRG1Q13488 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TCIRG1Q13488 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TCIRG1Q13488 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TCIRG1Q13488 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TCIRG1Q13488 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TCIRG1Q13488 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TCIRG1Q13488 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TCIRG1Q13488 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TCIRG1Q13488 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TCIRG1Q13488 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TCIRG1Q13488 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TCIRG1Q13488 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TCIRG1Q13488 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TCIRG1Q13488 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TCIRG1Q13488 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TCIRG1Q13488 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TCIRG1Q13488 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TCIRG1Q13488 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TCIRG1Q13488 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TCIRG1Q13488 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TCIRG1Q13488 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TCIRG1Q13488 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TCIRG1Q13488 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TCIRG1Q13488 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TCIRG1Q13488 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TCIRG1Q13488 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TCIRG1Q13488 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TCIRG1Q13488 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TCIRG1Q13488 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TCIRG1Q13488 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TCIRG1Q13488 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TCIRG1Q13488 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TCIRG1Q13488 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TCIRG1Q13488 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TCIRG1Q13488 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TCIRG1Q13488 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TCIRG1Q13488 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TCIRG1Q13488 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TCIRG1Q13488 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TCIRG1Q13488 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TCIRG1Q13488 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TCIRG1Q13488 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TCIRG1Q13488 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TCIRG1Q13488 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TCIRG1Q13488 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TCIRG1Q13488 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TCIRG1Q13488 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TCIRG1Q13488 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TCIRG1Q13488 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TCIRG1Q13488 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TCIRG1Q13488 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TCIRG1Q13488 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TCIRG1Q13488 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TCIRG1Q13488 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TCIRG1Q13488 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TCIRG1Q13488 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TCIRG1Q13488 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TCIRG1Q13488 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TCIRG1Q13488 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TCIRG1Q13488 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TCIRG1Q13488 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TCIRG1Q13488 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TCIRG1Q13488 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TCIRG1Q13488 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TCIRG1Q13488 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TCIRG1Q13488 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TCIRG1Q13488 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TCIRG1Q13488 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TCIRG1Q13488 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TCIRG1Q13488 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TCIRG1Q13488 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TCIRG1Q13488 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TCIRG1Q13488 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TCIRG1Q13488 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TCIRG1Q13488 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TCIRG1Q13488 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TCIRG1Q13488 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TCIRG1Q13488 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
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