Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MKRN4PQ13434 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MKRN4PQ13434 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MKRN4PQ13434 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MKRN4PQ13434 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MKRN4PQ13434 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MKRN4PQ13434 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MKRN4PQ13434 SLC14A1-206ENST00000535474 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MKRN4PQ13434 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MKRN4PQ13434 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MKRN4PQ13434 AP000873.2-201ENST00000602381 406 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MKRN4PQ13434 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MKRN4PQ13434 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MKRN4PQ13434 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MKRN4PQ13434 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MKRN4PQ13434 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MKRN4PQ13434 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MKRN4PQ13434 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
MKRN4PQ13434 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
MKRN4PQ13434 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MKRN4PQ13434 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MKRN4PQ13434 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MKRN4PQ13434 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MKRN4PQ13434 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MKRN4PQ13434 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MKRN4PQ13434 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MKRN4PQ13434 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MKRN4PQ13434 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MKRN4PQ13434 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MKRN4PQ13434 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MKRN4PQ13434 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MKRN4PQ13434 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MKRN4PQ13434 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MKRN4PQ13434 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MKRN4PQ13434 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MKRN4PQ13434 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MKRN4PQ13434 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MKRN4PQ13434 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
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MKRN4PQ13434 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MKRN4PQ13434 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MKRN4PQ13434 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
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MKRN4PQ13434 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MKRN4PQ13434 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MKRN4PQ13434 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MKRN4PQ13434 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MKRN4PQ13434 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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MKRN4PQ13434 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MKRN4PQ13434 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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MKRN4PQ13434 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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MKRN4PQ13434 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
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MKRN4PQ13434 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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MKRN4PQ13434 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MKRN4PQ13434 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MKRN4PQ13434 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MKRN4PQ13434 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MKRN4PQ13434 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
MKRN4PQ13434 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MKRN4PQ13434 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MKRN4PQ13434 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MKRN4PQ13434 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MKRN4PQ13434 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MKRN4PQ13434 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
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