Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SRSF6Q13247 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SRSF6Q13247 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SRSF6Q13247 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SRSF6Q13247 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SRSF6Q13247 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SRSF6Q13247 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SRSF6Q13247 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SRSF6Q13247 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SRSF6Q13247 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SRSF6Q13247 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SRSF6Q13247 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SRSF6Q13247 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SRSF6Q13247 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SRSF6Q13247 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SRSF6Q13247 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SRSF6Q13247 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SRSF6Q13247 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SRSF6Q13247 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SRSF6Q13247 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SRSF6Q13247 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SRSF6Q13247 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SRSF6Q13247 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SRSF6Q13247 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SRSF6Q13247 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SRSF6Q13247 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SRSF6Q13247 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SRSF6Q13247 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SRSF6Q13247 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SRSF6Q13247 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SRSF6Q13247 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SRSF6Q13247 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SRSF6Q13247 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SRSF6Q13247 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SRSF6Q13247 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SRSF6Q13247 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SRSF6Q13247 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SRSF6Q13247 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SRSF6Q13247 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SRSF6Q13247 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SRSF6Q13247 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SRSF6Q13247 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SRSF6Q13247 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SRSF6Q13247 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SRSF6Q13247 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SRSF6Q13247 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SRSF6Q13247 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SRSF6Q13247 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SRSF6Q13247 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SRSF6Q13247 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SRSF6Q13247 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SRSF6Q13247 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SRSF6Q13247 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SRSF6Q13247 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SRSF6Q13247 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SRSF6Q13247 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SRSF6Q13247 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SRSF6Q13247 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SRSF6Q13247 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SRSF6Q13247 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SRSF6Q13247 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SRSF6Q13247 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SRSF6Q13247 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SRSF6Q13247 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SRSF6Q13247 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SRSF6Q13247 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SRSF6Q13247 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
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