Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NME3Q13232 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NME3Q13232 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NME3Q13232 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NME3Q13232 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NME3Q13232 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NME3Q13232 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NME3Q13232 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NME3Q13232 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NME3Q13232 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NME3Q13232 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NME3Q13232 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NME3Q13232 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NME3Q13232 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NME3Q13232 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NME3Q13232 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NME3Q13232 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NME3Q13232 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NME3Q13232 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NME3Q13232 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NME3Q13232 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NME3Q13232 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NME3Q13232 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NME3Q13232 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NME3Q13232 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
NME3Q13232 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NME3Q13232 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NME3Q13232 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NME3Q13232 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NME3Q13232 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NME3Q13232 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
NME3Q13232 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
NME3Q13232 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NME3Q13232 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NME3Q13232 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NME3Q13232 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NME3Q13232 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NME3Q13232 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NME3Q13232 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NME3Q13232 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NME3Q13232 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NME3Q13232 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NME3Q13232 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NME3Q13232 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NME3Q13232 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NME3Q13232 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NME3Q13232 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NME3Q13232 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NME3Q13232 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NME3Q13232 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NME3Q13232 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NME3Q13232 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NME3Q13232 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NME3Q13232 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NME3Q13232 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NME3Q13232 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NME3Q13232 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NME3Q13232 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NME3Q13232 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NME3Q13232 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NME3Q13232 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NME3Q13232 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NME3Q13232 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NME3Q13232 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NME3Q13232 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NME3Q13232 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NME3Q13232 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
NME3Q13232 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NME3Q13232 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NME3Q13232 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NME3Q13232 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NME3Q13232 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NME3Q13232 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NME3Q13232 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NME3Q13232 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NME3Q13232 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NME3Q13232 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NME3Q13232 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NME3Q13232 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NME3Q13232 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NME3Q13232 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NME3Q13232 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NME3Q13232 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NME3Q13232 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NME3Q13232 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NME3Q13232 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NME3Q13232 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NME3Q13232 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NME3Q13232 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NME3Q13232 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NME3Q13232 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NME3Q13232 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NME3Q13232 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NME3Q13232 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NME3Q13232 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NME3Q13232 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NME3Q13232 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NME3Q13232 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NME3Q13232 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NME3Q13232 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
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