Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRAF1Q13077 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRAF1Q13077 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRAF1Q13077 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRAF1Q13077 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRAF1Q13077 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRAF1Q13077 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TRAF1Q13077 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAF1Q13077 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAF1Q13077 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAF1Q13077 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAF1Q13077 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAF1Q13077 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAF1Q13077 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAF1Q13077 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAF1Q13077 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAF1Q13077 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAF1Q13077 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAF1Q13077 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAF1Q13077 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAF1Q13077 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAF1Q13077 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAF1Q13077 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAF1Q13077 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAF1Q13077 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAF1Q13077 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAF1Q13077 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAF1Q13077 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAF1Q13077 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAF1Q13077 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAF1Q13077 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAF1Q13077 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAF1Q13077 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAF1Q13077 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAF1Q13077 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAF1Q13077 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAF1Q13077 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAF1Q13077 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAF1Q13077 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAF1Q13077 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAF1Q13077 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAF1Q13077 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAF1Q13077 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
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TRAF1Q13077 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
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TRAF1Q13077 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAF1Q13077 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAF1Q13077 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAF1Q13077 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
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TRAF1Q13077 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAF1Q13077 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAF1Q13077 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAF1Q13077 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAF1Q13077 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
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TRAF1Q13077 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAF1Q13077 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAF1Q13077 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
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TRAF1Q13077 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAF1Q13077 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAF1Q13077 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
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TRAF1Q13077 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
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TRAF1Q13077 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAF1Q13077 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
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TRAF1Q13077 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAF1Q13077 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAF1Q13077 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAF1Q13077 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAF1Q13077 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAF1Q13077 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAF1Q13077 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAF1Q13077 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAF1Q13077 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAF1Q13077 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAF1Q13077 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAF1Q13077 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAF1Q13077 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAF1Q13077 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAF1Q13077 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAF1Q13077 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAF1Q13077 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAF1Q13077 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAF1Q13077 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAF1Q13077 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
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