Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
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FOXC1Q12948 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FOXC1Q12948 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FOXC1Q12948 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FOXC1Q12948 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FOXC1Q12948 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FOXC1Q12948 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
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FOXC1Q12948 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
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FOXC1Q12948 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
FOXC1Q12948 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
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FOXC1Q12948 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
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FOXC1Q12948 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FOXC1Q12948 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FOXC1Q12948 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FOXC1Q12948 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
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FOXC1Q12948 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
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FOXC1Q12948 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
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FOXC1Q12948 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
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FOXC1Q12948 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXC1Q12948 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXC1Q12948 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXC1Q12948 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
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FOXC1Q12948 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXC1Q12948 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXC1Q12948 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXC1Q12948 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXC1Q12948 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXC1Q12948 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXC1Q12948 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXC1Q12948 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXC1Q12948 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
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